Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD3Q9UBI1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COMMD3Q9UBI1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD3Q9UBI1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COMMD3Q9UBI1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COMMD3Q9UBI1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COMMD3Q9UBI1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COMMD3Q9UBI1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD3Q9UBI1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD3Q9UBI1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD3Q9UBI1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COMMD3Q9UBI1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COMMD3Q9UBI1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COMMD3Q9UBI1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COMMD3Q9UBI1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COMMD3Q9UBI1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COMMD3Q9UBI1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD3Q9UBI1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD3Q9UBI1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD3Q9UBI1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD3Q9UBI1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD3Q9UBI1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COMMD3Q9UBI1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COMMD3Q9UBI1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COMMD3Q9UBI1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COMMD3Q9UBI1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COMMD3Q9UBI1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COMMD3Q9UBI1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COMMD3Q9UBI1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COMMD3Q9UBI1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD3Q9UBI1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COMMD3Q9UBI1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COMMD3Q9UBI1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COMMD3Q9UBI1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COMMD3Q9UBI1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COMMD3Q9UBI1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COMMD3Q9UBI1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
COMMD3Q9UBI1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COMMD3Q9UBI1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COMMD3Q9UBI1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COMMD3Q9UBI1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COMMD3Q9UBI1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COMMD3Q9UBI1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COMMD3Q9UBI1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COMMD3Q9UBI1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COMMD3Q9UBI1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD3Q9UBI1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD3Q9UBI1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COMMD3Q9UBI1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COMMD3Q9UBI1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COMMD3Q9UBI1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COMMD3Q9UBI1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COMMD3Q9UBI1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COMMD3Q9UBI1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COMMD3Q9UBI1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COMMD3Q9UBI1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COMMD3Q9UBI1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COMMD3Q9UBI1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COMMD3Q9UBI1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COMMD3Q9UBI1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COMMD3Q9UBI1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COMMD3Q9UBI1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD3Q9UBI1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COMMD3Q9UBI1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COMMD3Q9UBI1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COMMD3Q9UBI1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COMMD3Q9UBI1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COMMD3Q9UBI1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COMMD3Q9UBI1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD3Q9UBI1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD3Q9UBI1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COMMD3Q9UBI1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD3Q9UBI1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD3Q9UBI1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COMMD3Q9UBI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COMMD3Q9UBI1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COMMD3Q9UBI1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COMMD3Q9UBI1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COMMD3Q9UBI1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COMMD3Q9UBI1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COMMD3Q9UBI1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD3Q9UBI1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COMMD3Q9UBI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD3Q9UBI1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COMMD3Q9UBI1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COMMD3Q9UBI1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD3Q9UBI1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COMMD3Q9UBI1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COMMD3Q9UBI1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COMMD3Q9UBI1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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