Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDP2Q9P2J9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDP2Q9P2J9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDP2Q9P2J9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDP2Q9P2J9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDP2Q9P2J9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDP2Q9P2J9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDP2Q9P2J9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDP2Q9P2J9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDP2Q9P2J9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDP2Q9P2J9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDP2Q9P2J9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDP2Q9P2J9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDP2Q9P2J9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PDP2Q9P2J9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PDP2Q9P2J9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PDP2Q9P2J9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDP2Q9P2J9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PDP2Q9P2J9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDP2Q9P2J9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PDP2Q9P2J9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PDP2Q9P2J9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PDP2Q9P2J9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDP2Q9P2J9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDP2Q9P2J9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PDP2Q9P2J9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDP2Q9P2J9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PDP2Q9P2J9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDP2Q9P2J9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PDP2Q9P2J9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDP2Q9P2J9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDP2Q9P2J9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDP2Q9P2J9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDP2Q9P2J9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDP2Q9P2J9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDP2Q9P2J9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDP2Q9P2J9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDP2Q9P2J9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDP2Q9P2J9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDP2Q9P2J9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDP2Q9P2J9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDP2Q9P2J9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDP2Q9P2J9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDP2Q9P2J9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDP2Q9P2J9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDP2Q9P2J9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDP2Q9P2J9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDP2Q9P2J9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PDP2Q9P2J9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDP2Q9P2J9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDP2Q9P2J9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PDP2Q9P2J9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDP2Q9P2J9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDP2Q9P2J9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDP2Q9P2J9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDP2Q9P2J9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDP2Q9P2J9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDP2Q9P2J9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDP2Q9P2J9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDP2Q9P2J9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDP2Q9P2J9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDP2Q9P2J9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDP2Q9P2J9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDP2Q9P2J9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDP2Q9P2J9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDP2Q9P2J9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDP2Q9P2J9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDP2Q9P2J9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDP2Q9P2J9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDP2Q9P2J9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDP2Q9P2J9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDP2Q9P2J9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDP2Q9P2J9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDP2Q9P2J9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDP2Q9P2J9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDP2Q9P2J9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDP2Q9P2J9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDP2Q9P2J9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDP2Q9P2J9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDP2Q9P2J9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDP2Q9P2J9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDP2Q9P2J9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDP2Q9P2J9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDP2Q9P2J9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDP2Q9P2J9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDP2Q9P2J9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDP2Q9P2J9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDP2Q9P2J9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDP2Q9P2J9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDP2Q9P2J9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDP2Q9P2J9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDP2Q9P2J9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDP2Q9P2J9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PDP2Q9P2J9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDP2Q9P2J9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDP2Q9P2J9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDP2Q9P2J9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDP2Q9P2J9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDP2Q9P2J9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDP2Q9P2J9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms