Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COA4Q9NYJ1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COA4Q9NYJ1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COA4Q9NYJ1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COA4Q9NYJ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COA4Q9NYJ1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COA4Q9NYJ1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COA4Q9NYJ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
COA4Q9NYJ1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
COA4Q9NYJ1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
COA4Q9NYJ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COA4Q9NYJ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COA4Q9NYJ1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COA4Q9NYJ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COA4Q9NYJ1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COA4Q9NYJ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COA4Q9NYJ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COA4Q9NYJ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COA4Q9NYJ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COA4Q9NYJ1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COA4Q9NYJ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COA4Q9NYJ1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COA4Q9NYJ1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COA4Q9NYJ1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COA4Q9NYJ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COA4Q9NYJ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COA4Q9NYJ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COA4Q9NYJ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COA4Q9NYJ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COA4Q9NYJ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COA4Q9NYJ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COA4Q9NYJ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA4Q9NYJ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COA4Q9NYJ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COA4Q9NYJ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COA4Q9NYJ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COA4Q9NYJ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COA4Q9NYJ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COA4Q9NYJ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COA4Q9NYJ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COA4Q9NYJ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COA4Q9NYJ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COA4Q9NYJ1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COA4Q9NYJ1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COA4Q9NYJ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COA4Q9NYJ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COA4Q9NYJ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COA4Q9NYJ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COA4Q9NYJ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COA4Q9NYJ1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COA4Q9NYJ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COA4Q9NYJ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COA4Q9NYJ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COA4Q9NYJ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COA4Q9NYJ1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COA4Q9NYJ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COA4Q9NYJ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COA4Q9NYJ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COA4Q9NYJ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COA4Q9NYJ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COA4Q9NYJ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COA4Q9NYJ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COA4Q9NYJ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COA4Q9NYJ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COA4Q9NYJ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COA4Q9NYJ1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COA4Q9NYJ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COA4Q9NYJ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COA4Q9NYJ1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COA4Q9NYJ1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COA4Q9NYJ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COA4Q9NYJ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COA4Q9NYJ1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COA4Q9NYJ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COA4Q9NYJ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COA4Q9NYJ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COA4Q9NYJ1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COA4Q9NYJ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COA4Q9NYJ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COA4Q9NYJ1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms