Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
KCND1Q9NSA2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
KCND1Q9NSA2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KCND1Q9NSA2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KCND1Q9NSA2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KCND1Q9NSA2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KCND1Q9NSA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
KCND1Q9NSA2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
KCND1Q9NSA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
KCND1Q9NSA2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
KCND1Q9NSA2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KCND1Q9NSA2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
KCND1Q9NSA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KCND1Q9NSA2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KCND1Q9NSA2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KCND1Q9NSA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KCND1Q9NSA2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KCND1Q9NSA2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KCND1Q9NSA2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
KCND1Q9NSA2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KCND1Q9NSA2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KCND1Q9NSA2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KCND1Q9NSA2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KCND1Q9NSA2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KCND1Q9NSA2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KCND1Q9NSA2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KCND1Q9NSA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
KCND1Q9NSA2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KCND1Q9NSA2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KCND1Q9NSA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KCND1Q9NSA2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KCND1Q9NSA2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KCND1Q9NSA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KCND1Q9NSA2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
KCND1Q9NSA2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
KCND1Q9NSA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KCND1Q9NSA2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KCND1Q9NSA2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KCND1Q9NSA2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
KCND1Q9NSA2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
KCND1Q9NSA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
KCND1Q9NSA2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
KCND1Q9NSA2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
KCND1Q9NSA2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
KCND1Q9NSA2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
KCND1Q9NSA2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
KCND1Q9NSA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KCND1Q9NSA2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KCND1Q9NSA2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KCND1Q9NSA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCND1Q9NSA2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KCND1Q9NSA2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KCND1Q9NSA2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCND1Q9NSA2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KCND1Q9NSA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KCND1Q9NSA2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
KCND1Q9NSA2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
KCND1Q9NSA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCND1Q9NSA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
KCND1Q9NSA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
KCND1Q9NSA2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
KCND1Q9NSA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
KCND1Q9NSA2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
KCND1Q9NSA2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KCND1Q9NSA2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
KCND1Q9NSA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KCND1Q9NSA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
KCND1Q9NSA2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
KCND1Q9NSA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
KCND1Q9NSA2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
KCND1Q9NSA2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KCND1Q9NSA2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KCND1Q9NSA2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
KCND1Q9NSA2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
KCND1Q9NSA2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
KCND1Q9NSA2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
KCND1Q9NSA2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
KCND1Q9NSA2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
KCND1Q9NSA2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KCND1Q9NSA2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
KCND1Q9NSA2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
KCND1Q9NSA2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KCND1Q9NSA2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
KCND1Q9NSA2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
KCND1Q9NSA2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
KCND1Q9NSA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
KCND1Q9NSA2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
KCND1Q9NSA2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
KCND1Q9NSA2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
KCND1Q9NSA2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KCND1Q9NSA2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
KCND1Q9NSA2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KCND1Q9NSA2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
KCND1Q9NSA2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
KCND1Q9NSA2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
KCND1Q9NSA2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KCND1Q9NSA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
KCND1Q9NSA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
KCND1Q9NSA2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
KCND1Q9NSA2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms