Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIN28AQ9H9Z2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIN28AQ9H9Z2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIN28AQ9H9Z2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIN28AQ9H9Z2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LIN28AQ9H9Z2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIN28AQ9H9Z2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIN28AQ9H9Z2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIN28AQ9H9Z2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LIN28AQ9H9Z2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIN28AQ9H9Z2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIN28AQ9H9Z2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LIN28AQ9H9Z2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIN28AQ9H9Z2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LIN28AQ9H9Z2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIN28AQ9H9Z2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIN28AQ9H9Z2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIN28AQ9H9Z2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIN28AQ9H9Z2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LIN28AQ9H9Z2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIN28AQ9H9Z2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIN28AQ9H9Z2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIN28AQ9H9Z2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN28AQ9H9Z2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIN28AQ9H9Z2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LIN28AQ9H9Z2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LIN28AQ9H9Z2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIN28AQ9H9Z2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIN28AQ9H9Z2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIN28AQ9H9Z2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIN28AQ9H9Z2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIN28AQ9H9Z2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIN28AQ9H9Z2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIN28AQ9H9Z2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LIN28AQ9H9Z2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIN28AQ9H9Z2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LIN28AQ9H9Z2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIN28AQ9H9Z2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIN28AQ9H9Z2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN28AQ9H9Z2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIN28AQ9H9Z2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIN28AQ9H9Z2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIN28AQ9H9Z2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIN28AQ9H9Z2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIN28AQ9H9Z2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIN28AQ9H9Z2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIN28AQ9H9Z2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN28AQ9H9Z2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LIN28AQ9H9Z2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIN28AQ9H9Z2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIN28AQ9H9Z2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIN28AQ9H9Z2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN28AQ9H9Z2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIN28AQ9H9Z2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN28AQ9H9Z2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LIN28AQ9H9Z2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LIN28AQ9H9Z2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LIN28AQ9H9Z2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LIN28AQ9H9Z2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LIN28AQ9H9Z2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN28AQ9H9Z2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN28AQ9H9Z2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LIN28AQ9H9Z2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIN28AQ9H9Z2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LIN28AQ9H9Z2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN28AQ9H9Z2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LIN28AQ9H9Z2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN28AQ9H9Z2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LIN28AQ9H9Z2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LIN28AQ9H9Z2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN28AQ9H9Z2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LIN28AQ9H9Z2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIN28AQ9H9Z2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LIN28AQ9H9Z2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LIN28AQ9H9Z2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LIN28AQ9H9Z2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LIN28AQ9H9Z2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LIN28AQ9H9Z2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 712.7 ms