Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUBCNLQ9H714 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUBCNLQ9H714 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUBCNLQ9H714 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUBCNLQ9H714 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUBCNLQ9H714 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RUBCNLQ9H714 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNLQ9H714 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNLQ9H714 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNLQ9H714 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNLQ9H714 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RUBCNLQ9H714 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RUBCNLQ9H714 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RUBCNLQ9H714 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUBCNLQ9H714 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUBCNLQ9H714 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUBCNLQ9H714 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUBCNLQ9H714 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNLQ9H714 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUBCNLQ9H714 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUBCNLQ9H714 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUBCNLQ9H714 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUBCNLQ9H714 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUBCNLQ9H714 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUBCNLQ9H714 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RUBCNLQ9H714 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RUBCNLQ9H714 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RUBCNLQ9H714 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUBCNLQ9H714 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RUBCNLQ9H714 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUBCNLQ9H714 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RUBCNLQ9H714 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RUBCNLQ9H714 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUBCNLQ9H714 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RUBCNLQ9H714 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUBCNLQ9H714 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RUBCNLQ9H714 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RUBCNLQ9H714 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUBCNLQ9H714 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUBCNLQ9H714 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUBCNLQ9H714 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUBCNLQ9H714 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUBCNLQ9H714 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUBCNLQ9H714 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUBCNLQ9H714 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUBCNLQ9H714 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUBCNLQ9H714 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUBCNLQ9H714 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUBCNLQ9H714 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUBCNLQ9H714 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUBCNLQ9H714 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUBCNLQ9H714 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUBCNLQ9H714 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUBCNLQ9H714 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUBCNLQ9H714 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUBCNLQ9H714 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUBCNLQ9H714 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUBCNLQ9H714 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUBCNLQ9H714 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUBCNLQ9H714 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUBCNLQ9H714 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUBCNLQ9H714 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUBCNLQ9H714 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUBCNLQ9H714 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RUBCNLQ9H714 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RUBCNLQ9H714 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUBCNLQ9H714 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUBCNLQ9H714 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RUBCNLQ9H714 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RUBCNLQ9H714 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUBCNLQ9H714 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUBCNLQ9H714 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUBCNLQ9H714 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUBCNLQ9H714 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUBCNLQ9H714 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUBCNLQ9H714 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RUBCNLQ9H714 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RUBCNLQ9H714 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms