Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SH3GL2Q99962 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SH3GL2Q99962 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SH3GL2Q99962 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SH3GL2Q99962 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SH3GL2Q99962 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SH3GL2Q99962 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SH3GL2Q99962 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SH3GL2Q99962 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SH3GL2Q99962 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SH3GL2Q99962 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SH3GL2Q99962 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SH3GL2Q99962 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SH3GL2Q99962 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SH3GL2Q99962 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SH3GL2Q99962 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SH3GL2Q99962 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SH3GL2Q99962 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SH3GL2Q99962 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SH3GL2Q99962 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SH3GL2Q99962 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SH3GL2Q99962 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SH3GL2Q99962 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SH3GL2Q99962 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SH3GL2Q99962 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SH3GL2Q99962 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SH3GL2Q99962 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH3GL2Q99962 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SH3GL2Q99962 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SH3GL2Q99962 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SH3GL2Q99962 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3GL2Q99962 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3GL2Q99962 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SH3GL2Q99962 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SH3GL2Q99962 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH3GL2Q99962 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH3GL2Q99962 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH3GL2Q99962 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH3GL2Q99962 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH3GL2Q99962 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH3GL2Q99962 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH3GL2Q99962 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SH3GL2Q99962 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SH3GL2Q99962 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH3GL2Q99962 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH3GL2Q99962 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SH3GL2Q99962 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH3GL2Q99962 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH3GL2Q99962 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SH3GL2Q99962 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH3GL2Q99962 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3GL2Q99962 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3GL2Q99962 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH3GL2Q99962 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH3GL2Q99962 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH3GL2Q99962 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH3GL2Q99962 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH3GL2Q99962 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3GL2Q99962 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3GL2Q99962 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH3GL2Q99962 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3GL2Q99962 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3GL2Q99962 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3GL2Q99962 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH3GL2Q99962 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SH3GL2Q99962 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SH3GL2Q99962 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH3GL2Q99962 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH3GL2Q99962 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SH3GL2Q99962 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3GL2Q99962 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SH3GL2Q99962 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SH3GL2Q99962 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SH3GL2Q99962 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SH3GL2Q99962 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SH3GL2Q99962 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SH3GL2Q99962 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3GL2Q99962 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SH3GL2Q99962 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SH3GL2Q99962 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SH3GL2Q99962 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3GL2Q99962 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3GL2Q99962 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SH3GL2Q99962 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3GL2Q99962 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3GL2Q99962 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3GL2Q99962 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SH3GL2Q99962 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH3GL2Q99962 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SH3GL2Q99962 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SH3GL2Q99962 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3GL2Q99962 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3GL2Q99962 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SH3GL2Q99962 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SH3GL2Q99962 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SH3GL2Q99962 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SH3GL2Q99962 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SH3GL2Q99962 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
SH3GL2Q99962 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SH3GL2Q99962 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms