Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKP2Q99959 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKP2Q99959 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKP2Q99959 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKP2Q99959 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKP2Q99959 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKP2Q99959 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP2Q99959 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKP2Q99959 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKP2Q99959 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKP2Q99959 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKP2Q99959 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKP2Q99959 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKP2Q99959 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKP2Q99959 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP2Q99959 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKP2Q99959 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKP2Q99959 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP2Q99959 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKP2Q99959 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKP2Q99959 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKP2Q99959 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKP2Q99959 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKP2Q99959 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKP2Q99959 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP2Q99959 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKP2Q99959 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKP2Q99959 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKP2Q99959 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKP2Q99959 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKP2Q99959 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP2Q99959 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PKP2Q99959 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP2Q99959 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKP2Q99959 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKP2Q99959 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKP2Q99959 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKP2Q99959 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKP2Q99959 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKP2Q99959 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKP2Q99959 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKP2Q99959 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PKP2Q99959 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKP2Q99959 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKP2Q99959 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PKP2Q99959 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKP2Q99959 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKP2Q99959 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP2Q99959 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKP2Q99959 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKP2Q99959 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP2Q99959 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKP2Q99959 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKP2Q99959 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKP2Q99959 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKP2Q99959 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKP2Q99959 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKP2Q99959 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKP2Q99959 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKP2Q99959 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP2Q99959 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKP2Q99959 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKP2Q99959 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKP2Q99959 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP2Q99959 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKP2Q99959 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKP2Q99959 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKP2Q99959 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PKP2Q99959 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKP2Q99959 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PKP2Q99959 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKP2Q99959 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKP2Q99959 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKP2Q99959 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP2Q99959 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP2Q99959 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKP2Q99959 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKP2Q99959 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP2Q99959 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKP2Q99959 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms