Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF488Q96MN9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF488Q96MN9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF488Q96MN9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF488Q96MN9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF488Q96MN9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF488Q96MN9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF488Q96MN9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF488Q96MN9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF488Q96MN9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF488Q96MN9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF488Q96MN9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF488Q96MN9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF488Q96MN9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF488Q96MN9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF488Q96MN9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF488Q96MN9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF488Q96MN9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF488Q96MN9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF488Q96MN9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF488Q96MN9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF488Q96MN9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF488Q96MN9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF488Q96MN9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF488Q96MN9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF488Q96MN9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF488Q96MN9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF488Q96MN9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF488Q96MN9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF488Q96MN9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF488Q96MN9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF488Q96MN9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF488Q96MN9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF488Q96MN9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF488Q96MN9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF488Q96MN9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF488Q96MN9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF488Q96MN9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF488Q96MN9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF488Q96MN9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF488Q96MN9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF488Q96MN9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF488Q96MN9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF488Q96MN9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF488Q96MN9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF488Q96MN9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF488Q96MN9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF488Q96MN9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF488Q96MN9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF488Q96MN9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF488Q96MN9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF488Q96MN9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF488Q96MN9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF488Q96MN9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF488Q96MN9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF488Q96MN9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF488Q96MN9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF488Q96MN9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF488Q96MN9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF488Q96MN9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF488Q96MN9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF488Q96MN9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF488Q96MN9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF488Q96MN9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF488Q96MN9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF488Q96MN9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF488Q96MN9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF488Q96MN9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF488Q96MN9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF488Q96MN9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF488Q96MN9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF488Q96MN9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms