Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KLHL15Q96M94 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KLHL15Q96M94 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL15Q96M94 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL15Q96M94 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL15Q96M94 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL15Q96M94 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL15Q96M94 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL15Q96M94 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL15Q96M94 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL15Q96M94 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL15Q96M94 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL15Q96M94 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL15Q96M94 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL15Q96M94 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KLHL15Q96M94 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL15Q96M94 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL15Q96M94 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL15Q96M94 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL15Q96M94 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL15Q96M94 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL15Q96M94 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL15Q96M94 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL15Q96M94 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL15Q96M94 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL15Q96M94 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL15Q96M94 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL15Q96M94 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL15Q96M94 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL15Q96M94 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL15Q96M94 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL15Q96M94 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL15Q96M94 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL15Q96M94 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL15Q96M94 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KLHL15Q96M94 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL15Q96M94 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL15Q96M94 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL15Q96M94 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL15Q96M94 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL15Q96M94 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL15Q96M94 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL15Q96M94 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KLHL15Q96M94 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL15Q96M94 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL15Q96M94 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL15Q96M94 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL15Q96M94 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL15Q96M94 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL15Q96M94 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL15Q96M94 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL15Q96M94 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL15Q96M94 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL15Q96M94 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHL15Q96M94 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHL15Q96M94 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL15Q96M94 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL15Q96M94 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL15Q96M94 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL15Q96M94 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KLHL15Q96M94 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL15Q96M94 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL15Q96M94 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL15Q96M94 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL15Q96M94 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL15Q96M94 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL15Q96M94 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL15Q96M94 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL15Q96M94 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL15Q96M94 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KLHL15Q96M94 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL15Q96M94 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL15Q96M94 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KLHL15Q96M94 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL15Q96M94 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL15Q96M94 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL15Q96M94 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL15Q96M94 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL15Q96M94 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL15Q96M94 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL15Q96M94 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL15Q96M94 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL15Q96M94 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL15Q96M94 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL15Q96M94 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL15Q96M94 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL15Q96M94 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL15Q96M94 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL15Q96M94 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL15Q96M94 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms