Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SDCCAG3Q96C92 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SDCCAG3Q96C92 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDCCAG3Q96C92 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDCCAG3Q96C92 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDCCAG3Q96C92 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDCCAG3Q96C92 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDCCAG3Q96C92 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDCCAG3Q96C92 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SDCCAG3Q96C92 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDCCAG3Q96C92 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDCCAG3Q96C92 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDCCAG3Q96C92 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDCCAG3Q96C92 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDCCAG3Q96C92 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SDCCAG3Q96C92 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDCCAG3Q96C92 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SDCCAG3Q96C92 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDCCAG3Q96C92 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SDCCAG3Q96C92 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SDCCAG3Q96C92 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SDCCAG3Q96C92 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SDCCAG3Q96C92 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SDCCAG3Q96C92 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SDCCAG3Q96C92 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDCCAG3Q96C92 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SDCCAG3Q96C92 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDCCAG3Q96C92 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SDCCAG3Q96C92 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SDCCAG3Q96C92 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SDCCAG3Q96C92 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SDCCAG3Q96C92 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SDCCAG3Q96C92 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SDCCAG3Q96C92 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SDCCAG3Q96C92 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDCCAG3Q96C92 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDCCAG3Q96C92 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SDCCAG3Q96C92 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SDCCAG3Q96C92 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDCCAG3Q96C92 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SDCCAG3Q96C92 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SDCCAG3Q96C92 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SDCCAG3Q96C92 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDCCAG3Q96C92 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SDCCAG3Q96C92 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SDCCAG3Q96C92 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDCCAG3Q96C92 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDCCAG3Q96C92 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDCCAG3Q96C92 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SDCCAG3Q96C92 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SDCCAG3Q96C92 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SDCCAG3Q96C92 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDCCAG3Q96C92 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SDCCAG3Q96C92 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SDCCAG3Q96C92 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SDCCAG3Q96C92 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SDCCAG3Q96C92 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDCCAG3Q96C92 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDCCAG3Q96C92 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDCCAG3Q96C92 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SDCCAG3Q96C92 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SDCCAG3Q96C92 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SDCCAG3Q96C92 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SDCCAG3Q96C92 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SDCCAG3Q96C92 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDCCAG3Q96C92 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SDCCAG3Q96C92 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDCCAG3Q96C92 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SDCCAG3Q96C92 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SDCCAG3Q96C92 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDCCAG3Q96C92 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SDCCAG3Q96C92 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDCCAG3Q96C92 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SDCCAG3Q96C92 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SDCCAG3Q96C92 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDCCAG3Q96C92 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SDCCAG3Q96C92 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SDCCAG3Q96C92 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms