Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CLUAP1Q96AJ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CLUAP1Q96AJ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLUAP1Q96AJ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CLUAP1Q96AJ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
CLUAP1Q96AJ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CLUAP1Q96AJ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CLUAP1Q96AJ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CLUAP1Q96AJ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CLUAP1Q96AJ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CLUAP1Q96AJ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLUAP1Q96AJ1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CLUAP1Q96AJ1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CLUAP1Q96AJ1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLUAP1Q96AJ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLUAP1Q96AJ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CLUAP1Q96AJ1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLUAP1Q96AJ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CLUAP1Q96AJ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CLUAP1Q96AJ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CLUAP1Q96AJ1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
CLUAP1Q96AJ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CLUAP1Q96AJ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLUAP1Q96AJ1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CLUAP1Q96AJ1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CLUAP1Q96AJ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CLUAP1Q96AJ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CLUAP1Q96AJ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CLUAP1Q96AJ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CLUAP1Q96AJ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLUAP1Q96AJ1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CLUAP1Q96AJ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CLUAP1Q96AJ1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CLUAP1Q96AJ1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CLUAP1Q96AJ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CLUAP1Q96AJ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CLUAP1Q96AJ1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLUAP1Q96AJ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
CLUAP1Q96AJ1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLUAP1Q96AJ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CLUAP1Q96AJ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CLUAP1Q96AJ1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLUAP1Q96AJ1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CLUAP1Q96AJ1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CLUAP1Q96AJ1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CLUAP1Q96AJ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CLUAP1Q96AJ1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CLUAP1Q96AJ1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CLUAP1Q96AJ1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CLUAP1Q96AJ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CLUAP1Q96AJ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CLUAP1Q96AJ1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CLUAP1Q96AJ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CLUAP1Q96AJ1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLUAP1Q96AJ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLUAP1Q96AJ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
CLUAP1Q96AJ1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CLUAP1Q96AJ1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLUAP1Q96AJ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLUAP1Q96AJ1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLUAP1Q96AJ1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CLUAP1Q96AJ1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLUAP1Q96AJ1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLUAP1Q96AJ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLUAP1Q96AJ1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLUAP1Q96AJ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLUAP1Q96AJ1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLUAP1Q96AJ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLUAP1Q96AJ1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLUAP1Q96AJ1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLUAP1Q96AJ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CLUAP1Q96AJ1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLUAP1Q96AJ1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLUAP1Q96AJ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLUAP1Q96AJ1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLUAP1Q96AJ1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLUAP1Q96AJ1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLUAP1Q96AJ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLUAP1Q96AJ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLUAP1Q96AJ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLUAP1Q96AJ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLUAP1Q96AJ1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLUAP1Q96AJ1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLUAP1Q96AJ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLUAP1Q96AJ1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CLUAP1Q96AJ1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLUAP1Q96AJ1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CLUAP1Q96AJ1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLUAP1Q96AJ1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CLUAP1Q96AJ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CLUAP1Q96AJ1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLUAP1Q96AJ1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CLUAP1Q96AJ1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLUAP1Q96AJ1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
CLUAP1Q96AJ1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLUAP1Q96AJ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLUAP1Q96AJ1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CLUAP1Q96AJ1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CLUAP1Q96AJ1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms