Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDB2Q92466 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB2Q92466 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB2Q92466 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDB2Q92466 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB2Q92466 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDB2Q92466 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDB2Q92466 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDB2Q92466 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDB2Q92466 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DDB2Q92466 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DDB2Q92466 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB2Q92466 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DDB2Q92466 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DDB2Q92466 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DDB2Q92466 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB2Q92466 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDB2Q92466 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDB2Q92466 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDB2Q92466 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB2Q92466 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB2Q92466 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDB2Q92466 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB2Q92466 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB2Q92466 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDB2Q92466 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDB2Q92466 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDB2Q92466 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDB2Q92466 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB2Q92466 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDB2Q92466 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDB2Q92466 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDB2Q92466 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDB2Q92466 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB2Q92466 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB2Q92466 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB2Q92466 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDB2Q92466 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDB2Q92466 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDB2Q92466 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDB2Q92466 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDB2Q92466 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDB2Q92466 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DDB2Q92466 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDB2Q92466 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDB2Q92466 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDB2Q92466 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDB2Q92466 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDB2Q92466 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDB2Q92466 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDB2Q92466 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDB2Q92466 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDB2Q92466 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB2Q92466 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDB2Q92466 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDB2Q92466 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDB2Q92466 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB2Q92466 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB2Q92466 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDB2Q92466 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms