Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFT2D1Q8WV19 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFT2D1Q8WV19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFT2D1Q8WV19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFT2D1Q8WV19 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFT2D1Q8WV19 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D1Q8WV19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D1Q8WV19 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFT2D1Q8WV19 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFT2D1Q8WV19 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SFT2D1Q8WV19 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SFT2D1Q8WV19 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SFT2D1Q8WV19 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SFT2D1Q8WV19 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SFT2D1Q8WV19 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFT2D1Q8WV19 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SFT2D1Q8WV19 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SFT2D1Q8WV19 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SFT2D1Q8WV19 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SFT2D1Q8WV19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFT2D1Q8WV19 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFT2D1Q8WV19 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SFT2D1Q8WV19 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SFT2D1Q8WV19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFT2D1Q8WV19 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFT2D1Q8WV19 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SFT2D1Q8WV19 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFT2D1Q8WV19 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SFT2D1Q8WV19 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SFT2D1Q8WV19 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFT2D1Q8WV19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFT2D1Q8WV19 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFT2D1Q8WV19 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFT2D1Q8WV19 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFT2D1Q8WV19 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFT2D1Q8WV19 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFT2D1Q8WV19 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFT2D1Q8WV19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFT2D1Q8WV19 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFT2D1Q8WV19 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFT2D1Q8WV19 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFT2D1Q8WV19 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFT2D1Q8WV19 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFT2D1Q8WV19 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFT2D1Q8WV19 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFT2D1Q8WV19 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D1Q8WV19 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D1Q8WV19 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFT2D1Q8WV19 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFT2D1Q8WV19 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SFT2D1Q8WV19 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SFT2D1Q8WV19 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SFT2D1Q8WV19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFT2D1Q8WV19 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFT2D1Q8WV19 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SFT2D1Q8WV19 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFT2D1Q8WV19 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SFT2D1Q8WV19 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D1Q8WV19 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D1Q8WV19 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D1Q8WV19 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SFT2D1Q8WV19 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D1Q8WV19 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SFT2D1Q8WV19 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SFT2D1Q8WV19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SFT2D1Q8WV19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D1Q8WV19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SFT2D1Q8WV19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SFT2D1Q8WV19 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D1Q8WV19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D1Q8WV19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SFT2D1Q8WV19 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D1Q8WV19 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D1Q8WV19 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SFT2D1Q8WV19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SFT2D1Q8WV19 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms