Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET8

TRPV3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV3Q8NET8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRPV3Q8NET8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPV3Q8NET8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRPV3Q8NET8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRPV3Q8NET8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRPV3Q8NET8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRPV3Q8NET8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRPV3Q8NET8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRPV3Q8NET8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRPV3Q8NET8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRPV3Q8NET8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRPV3Q8NET8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TRPV3Q8NET8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPV3Q8NET8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPV3Q8NET8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPV3Q8NET8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRPV3Q8NET8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRPV3Q8NET8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRPV3Q8NET8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRPV3Q8NET8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRPV3Q8NET8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRPV3Q8NET8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRPV3Q8NET8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRPV3Q8NET8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPV3Q8NET8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRPV3Q8NET8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRPV3Q8NET8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRPV3Q8NET8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRPV3Q8NET8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRPV3Q8NET8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRPV3Q8NET8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRPV3Q8NET8 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRPV3Q8NET8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRPV3Q8NET8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRPV3Q8NET8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPV3Q8NET8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRPV3Q8NET8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRPV3Q8NET8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRPV3Q8NET8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRPV3Q8NET8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRPV3Q8NET8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRPV3Q8NET8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRPV3Q8NET8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRPV3Q8NET8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPV3Q8NET8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRPV3Q8NET8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRPV3Q8NET8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRPV3Q8NET8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV3Q8NET8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRPV3Q8NET8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRPV3Q8NET8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRPV3Q8NET8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRPV3Q8NET8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPV3Q8NET8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRPV3Q8NET8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPV3Q8NET8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPV3Q8NET8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPV3Q8NET8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRPV3Q8NET8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPV3Q8NET8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRPV3Q8NET8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRPV3Q8NET8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV3Q8NET8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV3Q8NET8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRPV3Q8NET8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRPV3Q8NET8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRPV3Q8NET8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPV3Q8NET8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRPV3Q8NET8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV3Q8NET8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRPV3Q8NET8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRPV3Q8NET8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRPV3Q8NET8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPV3Q8NET8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPV3Q8NET8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRPV3Q8NET8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV3Q8NET8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV3Q8NET8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRPV3Q8NET8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRPV3Q8NET8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms