Protein–RNA interactions for Protein: Q8N485

LIX1, Protein limb expression 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIX1Q8N485 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LIX1Q8N485 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LIX1Q8N485 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LIX1Q8N485 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LIX1Q8N485 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LIX1Q8N485 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LIX1Q8N485 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LIX1Q8N485 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LIX1Q8N485 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LIX1Q8N485 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LIX1Q8N485 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIX1Q8N485 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LIX1Q8N485 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIX1Q8N485 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LIX1Q8N485 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LIX1Q8N485 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIX1Q8N485 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LIX1Q8N485 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LIX1Q8N485 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LIX1Q8N485 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIX1Q8N485 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIX1Q8N485 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIX1Q8N485 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LIX1Q8N485 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LIX1Q8N485 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LIX1Q8N485 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LIX1Q8N485 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LIX1Q8N485 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LIX1Q8N485 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LIX1Q8N485 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIX1Q8N485 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIX1Q8N485 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LIX1Q8N485 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIX1Q8N485 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIX1Q8N485 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIX1Q8N485 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIX1Q8N485 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIX1Q8N485 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIX1Q8N485 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIX1Q8N485 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIX1Q8N485 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIX1Q8N485 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LIX1Q8N485 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LIX1Q8N485 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIX1Q8N485 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIX1Q8N485 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIX1Q8N485 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIX1Q8N485 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIX1Q8N485 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIX1Q8N485 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIX1Q8N485 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LIX1Q8N485 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIX1Q8N485 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LIX1Q8N485 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LIX1Q8N485 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIX1Q8N485 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LIX1Q8N485 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LIX1Q8N485 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LIX1Q8N485 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LIX1Q8N485 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LIX1Q8N485 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIX1Q8N485 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIX1Q8N485 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LIX1Q8N485 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LIX1Q8N485 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIX1Q8N485 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIX1Q8N485 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LIX1Q8N485 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LIX1Q8N485 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LIX1Q8N485 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIX1Q8N485 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LIX1Q8N485 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIX1Q8N485 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LIX1Q8N485 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIX1Q8N485 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LIX1Q8N485 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LIX1Q8N485 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LIX1Q8N485 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIX1Q8N485 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIX1Q8N485 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LIX1Q8N485 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LIX1Q8N485 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LIX1Q8N485 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIX1Q8N485 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LIX1Q8N485 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LIX1Q8N485 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIX1Q8N485 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LIX1Q8N485 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIX1Q8N485 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LIX1Q8N485 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIX1Q8N485 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIX1Q8N485 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LIX1Q8N485 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIX1Q8N485 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LIX1Q8N485 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LIX1Q8N485 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIX1Q8N485 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LIX1Q8N485 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LIX1Q8N485 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LIX1Q8N485 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms