Protein–RNA interactions for Protein: Q8N119

MMP21, Matrix metalloproteinase-21, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP21Q8N119 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP21Q8N119 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP21Q8N119 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP21Q8N119 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP21Q8N119 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP21Q8N119 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP21Q8N119 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP21Q8N119 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP21Q8N119 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP21Q8N119 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP21Q8N119 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP21Q8N119 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP21Q8N119 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP21Q8N119 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP21Q8N119 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP21Q8N119 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP21Q8N119 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP21Q8N119 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP21Q8N119 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP21Q8N119 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP21Q8N119 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP21Q8N119 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP21Q8N119 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP21Q8N119 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP21Q8N119 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP21Q8N119 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP21Q8N119 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP21Q8N119 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP21Q8N119 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP21Q8N119 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP21Q8N119 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP21Q8N119 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP21Q8N119 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP21Q8N119 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP21Q8N119 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP21Q8N119 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP21Q8N119 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MMP21Q8N119 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP21Q8N119 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MMP21Q8N119 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MMP21Q8N119 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP21Q8N119 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MMP21Q8N119 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MMP21Q8N119 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MMP21Q8N119 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MMP21Q8N119 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP21Q8N119 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MMP21Q8N119 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP21Q8N119 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MMP21Q8N119 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MMP21Q8N119 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP21Q8N119 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MMP21Q8N119 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP21Q8N119 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP21Q8N119 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MMP21Q8N119 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP21Q8N119 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP21Q8N119 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MMP21Q8N119 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP21Q8N119 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MMP21Q8N119 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP21Q8N119 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP21Q8N119 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MMP21Q8N119 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MMP21Q8N119 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MMP21Q8N119 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MMP21Q8N119 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MMP21Q8N119 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MMP21Q8N119 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP21Q8N119 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MMP21Q8N119 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MMP21Q8N119 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP21Q8N119 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP21Q8N119 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MMP21Q8N119 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MMP21Q8N119 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP21Q8N119 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MMP21Q8N119 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MMP21Q8N119 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP21Q8N119 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP21Q8N119 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP21Q8N119 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MMP21Q8N119 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MMP21Q8N119 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP21Q8N119 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MMP21Q8N119 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms