Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZV5

RDH10, Retinol dehydrogenase 10, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH10Q8IZV5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RDH10Q8IZV5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH10Q8IZV5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RDH10Q8IZV5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RDH10Q8IZV5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RDH10Q8IZV5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RDH10Q8IZV5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RDH10Q8IZV5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RDH10Q8IZV5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RDH10Q8IZV5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RDH10Q8IZV5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH10Q8IZV5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH10Q8IZV5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RDH10Q8IZV5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RDH10Q8IZV5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RDH10Q8IZV5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH10Q8IZV5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RDH10Q8IZV5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RDH10Q8IZV5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RDH10Q8IZV5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RDH10Q8IZV5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RDH10Q8IZV5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RDH10Q8IZV5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH10Q8IZV5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RDH10Q8IZV5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH10Q8IZV5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RDH10Q8IZV5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RDH10Q8IZV5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RDH10Q8IZV5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDH10Q8IZV5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDH10Q8IZV5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RDH10Q8IZV5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RDH10Q8IZV5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RDH10Q8IZV5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RDH10Q8IZV5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RDH10Q8IZV5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RDH10Q8IZV5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RDH10Q8IZV5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RDH10Q8IZV5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RDH10Q8IZV5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RDH10Q8IZV5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH10Q8IZV5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RDH10Q8IZV5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RDH10Q8IZV5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RDH10Q8IZV5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RDH10Q8IZV5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH10Q8IZV5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH10Q8IZV5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RDH10Q8IZV5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RDH10Q8IZV5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDH10Q8IZV5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RDH10Q8IZV5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RDH10Q8IZV5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH10Q8IZV5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RDH10Q8IZV5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RDH10Q8IZV5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RDH10Q8IZV5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH10Q8IZV5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH10Q8IZV5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RDH10Q8IZV5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RDH10Q8IZV5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RDH10Q8IZV5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RDH10Q8IZV5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RDH10Q8IZV5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RDH10Q8IZV5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RDH10Q8IZV5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RDH10Q8IZV5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RDH10Q8IZV5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RDH10Q8IZV5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH10Q8IZV5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RDH10Q8IZV5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH10Q8IZV5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RDH10Q8IZV5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RDH10Q8IZV5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RDH10Q8IZV5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RDH10Q8IZV5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RDH10Q8IZV5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RDH10Q8IZV5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDH10Q8IZV5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RDH10Q8IZV5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDH10Q8IZV5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RDH10Q8IZV5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDH10Q8IZV5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDH10Q8IZV5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDH10Q8IZV5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RDH10Q8IZV5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH10Q8IZV5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RDH10Q8IZV5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RDH10Q8IZV5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RDH10Q8IZV5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms