Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPF39Q86UA1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRPF39Q86UA1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF39Q86UA1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRPF39Q86UA1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRPF39Q86UA1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRPF39Q86UA1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PRPF39Q86UA1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF39Q86UA1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRPF39Q86UA1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRPF39Q86UA1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF39Q86UA1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF39Q86UA1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRPF39Q86UA1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF39Q86UA1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF39Q86UA1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRPF39Q86UA1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRPF39Q86UA1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
PRPF39Q86UA1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF39Q86UA1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRPF39Q86UA1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRPF39Q86UA1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF39Q86UA1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF39Q86UA1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRPF39Q86UA1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRPF39Q86UA1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PRPF39Q86UA1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF39Q86UA1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF39Q86UA1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PRPF39Q86UA1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRPF39Q86UA1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRPF39Q86UA1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF39Q86UA1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF39Q86UA1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PRPF39Q86UA1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PRPF39Q86UA1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PRPF39Q86UA1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF39Q86UA1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PRPF39Q86UA1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRPF39Q86UA1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF39Q86UA1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRPF39Q86UA1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRPF39Q86UA1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRPF39Q86UA1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRPF39Q86UA1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRPF39Q86UA1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF39Q86UA1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PRPF39Q86UA1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF39Q86UA1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF39Q86UA1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRPF39Q86UA1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF39Q86UA1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRPF39Q86UA1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRPF39Q86UA1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRPF39Q86UA1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF39Q86UA1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF39Q86UA1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRPF39Q86UA1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRPF39Q86UA1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRPF39Q86UA1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRPF39Q86UA1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRPF39Q86UA1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRPF39Q86UA1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF39Q86UA1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRPF39Q86UA1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRPF39Q86UA1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF39Q86UA1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRPF39Q86UA1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF39Q86UA1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF39Q86UA1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRPF39Q86UA1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRPF39Q86UA1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF39Q86UA1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF39Q86UA1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRPF39Q86UA1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRPF39Q86UA1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRPF39Q86UA1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRPF39Q86UA1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRPF39Q86UA1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms