Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BRAPQ7Z569 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BRAPQ7Z569 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BRAPQ7Z569 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BRAPQ7Z569 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BRAPQ7Z569 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BRAPQ7Z569 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BRAPQ7Z569 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BRAPQ7Z569 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BRAPQ7Z569 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BRAPQ7Z569 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
BRAPQ7Z569 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BRAPQ7Z569 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BRAPQ7Z569 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BRAPQ7Z569 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BRAPQ7Z569 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BRAPQ7Z569 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BRAPQ7Z569 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BRAPQ7Z569 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
BRAPQ7Z569 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BRAPQ7Z569 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
BRAPQ7Z569 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
BRAPQ7Z569 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
BRAPQ7Z569 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
BRAPQ7Z569 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
BRAPQ7Z569 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
BRAPQ7Z569 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
BRAPQ7Z569 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
BRAPQ7Z569 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BRAPQ7Z569 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
BRAPQ7Z569 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
BRAPQ7Z569 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
BRAPQ7Z569 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
BRAPQ7Z569 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRAPQ7Z569 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRAPQ7Z569 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
BRAPQ7Z569 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
BRAPQ7Z569 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BRAPQ7Z569 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
BRAPQ7Z569 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
BRAPQ7Z569 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
BRAPQ7Z569 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
BRAPQ7Z569 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
BRAPQ7Z569 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
BRAPQ7Z569 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
BRAPQ7Z569 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
BRAPQ7Z569 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
BRAPQ7Z569 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
BRAPQ7Z569 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
BRAPQ7Z569 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
BRAPQ7Z569 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
BRAPQ7Z569 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
BRAPQ7Z569 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
BRAPQ7Z569 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
BRAPQ7Z569 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
BRAPQ7Z569 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
BRAPQ7Z569 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
BRAPQ7Z569 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BRAPQ7Z569 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BRAPQ7Z569 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
BRAPQ7Z569 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
BRAPQ7Z569 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BRAPQ7Z569 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
BRAPQ7Z569 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRAPQ7Z569 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BRAPQ7Z569 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BRAPQ7Z569 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BRAPQ7Z569 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
BRAPQ7Z569 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRAPQ7Z569 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
BRAPQ7Z569 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRAPQ7Z569 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRAPQ7Z569 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRAPQ7Z569 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRAPQ7Z569 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BRAPQ7Z569 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRAPQ7Z569 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRAPQ7Z569 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRAPQ7Z569 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRAPQ7Z569 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRAPQ7Z569 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRAPQ7Z569 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRAPQ7Z569 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRAPQ7Z569 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRAPQ7Z569 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRAPQ7Z569 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRAPQ7Z569 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRAPQ7Z569 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRAPQ7Z569 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
BRAPQ7Z569 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms