Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CACNA2D4Q7Z3S7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CACNA2D4Q7Z3S7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CACNA2D4Q7Z3S7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNA2D4Q7Z3S7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CACNA2D4Q7Z3S7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CACNA2D4Q7Z3S7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CACNA2D4Q7Z3S7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CACNA2D4Q7Z3S7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CACNA2D4Q7Z3S7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CACNA2D4Q7Z3S7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CACNA2D4Q7Z3S7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CACNA2D4Q7Z3S7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CACNA2D4Q7Z3S7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CACNA2D4Q7Z3S7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CACNA2D4Q7Z3S7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CACNA2D4Q7Z3S7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CACNA2D4Q7Z3S7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CACNA2D4Q7Z3S7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CACNA2D4Q7Z3S7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CACNA2D4Q7Z3S7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CACNA2D4Q7Z3S7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CACNA2D4Q7Z3S7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CACNA2D4Q7Z3S7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNA2D4Q7Z3S7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CACNA2D4Q7Z3S7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CACNA2D4Q7Z3S7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNA2D4Q7Z3S7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNA2D4Q7Z3S7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNA2D4Q7Z3S7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNA2D4Q7Z3S7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNA2D4Q7Z3S7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA2D4Q7Z3S7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CACNA2D4Q7Z3S7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CACNA2D4Q7Z3S7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CACNA2D4Q7Z3S7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CACNA2D4Q7Z3S7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNA2D4Q7Z3S7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CACNA2D4Q7Z3S7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CACNA2D4Q7Z3S7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CACNA2D4Q7Z3S7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA2D4Q7Z3S7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CACNA2D4Q7Z3S7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CACNA2D4Q7Z3S7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CACNA2D4Q7Z3S7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNA2D4Q7Z3S7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNA2D4Q7Z3S7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA2D4Q7Z3S7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA2D4Q7Z3S7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNA2D4Q7Z3S7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNA2D4Q7Z3S7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNA2D4Q7Z3S7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNA2D4Q7Z3S7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNA2D4Q7Z3S7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms