Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2R9

SSBP3-AS1, Putative uncharacterized protein SSBP3-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-AS1Q7Z2R9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SSBP3-AS1Q7Z2R9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SSBP3-AS1Q7Z2R9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SSBP3-AS1Q7Z2R9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP3-AS1Q7Z2R9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSBP3-AS1Q7Z2R9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSBP3-AS1Q7Z2R9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SSBP3-AS1Q7Z2R9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP3-AS1Q7Z2R9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP3-AS1Q7Z2R9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1Q7Z2R9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1Q7Z2R9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SSBP3-AS1Q7Z2R9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SSBP3-AS1Q7Z2R9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms