Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB3

LYPD2, Ly6/PLAUR domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD2Q6UXB3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYPD2Q6UXB3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYPD2Q6UXB3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LYPD2Q6UXB3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LYPD2Q6UXB3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LYPD2Q6UXB3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYPD2Q6UXB3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LYPD2Q6UXB3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LYPD2Q6UXB3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LYPD2Q6UXB3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYPD2Q6UXB3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LYPD2Q6UXB3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LYPD2Q6UXB3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LYPD2Q6UXB3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYPD2Q6UXB3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYPD2Q6UXB3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LYPD2Q6UXB3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LYPD2Q6UXB3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LYPD2Q6UXB3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LYPD2Q6UXB3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYPD2Q6UXB3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYPD2Q6UXB3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LYPD2Q6UXB3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYPD2Q6UXB3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LYPD2Q6UXB3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYPD2Q6UXB3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LYPD2Q6UXB3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYPD2Q6UXB3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LYPD2Q6UXB3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LYPD2Q6UXB3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LYPD2Q6UXB3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LYPD2Q6UXB3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LYPD2Q6UXB3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LYPD2Q6UXB3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LYPD2Q6UXB3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYPD2Q6UXB3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LYPD2Q6UXB3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LYPD2Q6UXB3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LYPD2Q6UXB3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LYPD2Q6UXB3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LYPD2Q6UXB3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LYPD2Q6UXB3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LYPD2Q6UXB3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LYPD2Q6UXB3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LYPD2Q6UXB3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYPD2Q6UXB3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LYPD2Q6UXB3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LYPD2Q6UXB3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYPD2Q6UXB3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LYPD2Q6UXB3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LYPD2Q6UXB3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LYPD2Q6UXB3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYPD2Q6UXB3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LYPD2Q6UXB3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LYPD2Q6UXB3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LYPD2Q6UXB3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LYPD2Q6UXB3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYPD2Q6UXB3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LYPD2Q6UXB3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LYPD2Q6UXB3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LYPD2Q6UXB3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LYPD2Q6UXB3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYPD2Q6UXB3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LYPD2Q6UXB3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LYPD2Q6UXB3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LYPD2Q6UXB3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYPD2Q6UXB3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LYPD2Q6UXB3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LYPD2Q6UXB3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD2Q6UXB3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD2Q6UXB3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LYPD2Q6UXB3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LYPD2Q6UXB3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYPD2Q6UXB3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LYPD2Q6UXB3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYPD2Q6UXB3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LYPD2Q6UXB3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LYPD2Q6UXB3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LYPD2Q6UXB3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms