Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB3

LYPD2, Ly6/PLAUR domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD2Q6UXB3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LYPD2Q6UXB3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LYPD2Q6UXB3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LYPD2Q6UXB3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LYPD2Q6UXB3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LYPD2Q6UXB3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LYPD2Q6UXB3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LYPD2Q6UXB3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LYPD2Q6UXB3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LYPD2Q6UXB3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LYPD2Q6UXB3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LYPD2Q6UXB3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LYPD2Q6UXB3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LYPD2Q6UXB3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LYPD2Q6UXB3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LYPD2Q6UXB3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LYPD2Q6UXB3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LYPD2Q6UXB3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LYPD2Q6UXB3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LYPD2Q6UXB3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LYPD2Q6UXB3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LYPD2Q6UXB3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LYPD2Q6UXB3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LYPD2Q6UXB3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LYPD2Q6UXB3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LYPD2Q6UXB3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LYPD2Q6UXB3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LYPD2Q6UXB3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LYPD2Q6UXB3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LYPD2Q6UXB3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LYPD2Q6UXB3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LYPD2Q6UXB3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LYPD2Q6UXB3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LYPD2Q6UXB3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LYPD2Q6UXB3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LYPD2Q6UXB3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LYPD2Q6UXB3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LYPD2Q6UXB3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LYPD2Q6UXB3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LYPD2Q6UXB3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LYPD2Q6UXB3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LYPD2Q6UXB3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LYPD2Q6UXB3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LYPD2Q6UXB3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LYPD2Q6UXB3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LYPD2Q6UXB3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LYPD2Q6UXB3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LYPD2Q6UXB3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LYPD2Q6UXB3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LYPD2Q6UXB3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LYPD2Q6UXB3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LYPD2Q6UXB3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LYPD2Q6UXB3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LYPD2Q6UXB3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYPD2Q6UXB3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LYPD2Q6UXB3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LYPD2Q6UXB3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LYPD2Q6UXB3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LYPD2Q6UXB3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LYPD2Q6UXB3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LYPD2Q6UXB3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LYPD2Q6UXB3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LYPD2Q6UXB3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LYPD2Q6UXB3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LYPD2Q6UXB3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LYPD2Q6UXB3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYPD2Q6UXB3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LYPD2Q6UXB3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LYPD2Q6UXB3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LYPD2Q6UXB3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LYPD2Q6UXB3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYPD2Q6UXB3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LYPD2Q6UXB3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LYPD2Q6UXB3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LYPD2Q6UXB3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LYPD2Q6UXB3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LYPD2Q6UXB3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LYPD2Q6UXB3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LYPD2Q6UXB3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LYPD2Q6UXB3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LYPD2Q6UXB3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LYPD2Q6UXB3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYPD2Q6UXB3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LYPD2Q6UXB3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LYPD2Q6UXB3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYPD2Q6UXB3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYPD2Q6UXB3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYPD2Q6UXB3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LYPD2Q6UXB3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LYPD2Q6UXB3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LYPD2Q6UXB3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LYPD2Q6UXB3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYPD2Q6UXB3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYPD2Q6UXB3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LYPD2Q6UXB3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LYPD2Q6UXB3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LYPD2Q6UXB3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LYPD2Q6UXB3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LYPD2Q6UXB3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LYPD2Q6UXB3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.9 ms