Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IRGCQ6NXR0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IRGCQ6NXR0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IRGCQ6NXR0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IRGCQ6NXR0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IRGCQ6NXR0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRGCQ6NXR0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IRGCQ6NXR0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IRGCQ6NXR0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRGCQ6NXR0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IRGCQ6NXR0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IRGCQ6NXR0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IRGCQ6NXR0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
IRGCQ6NXR0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRGCQ6NXR0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IRGCQ6NXR0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IRGCQ6NXR0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IRGCQ6NXR0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IRGCQ6NXR0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRGCQ6NXR0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IRGCQ6NXR0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRGCQ6NXR0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRGCQ6NXR0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRGCQ6NXR0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRGCQ6NXR0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRGCQ6NXR0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRGCQ6NXR0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRGCQ6NXR0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRGCQ6NXR0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRGCQ6NXR0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRGCQ6NXR0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IRGCQ6NXR0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IRGCQ6NXR0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IRGCQ6NXR0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IRGCQ6NXR0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IRGCQ6NXR0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRGCQ6NXR0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRGCQ6NXR0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRGCQ6NXR0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRGCQ6NXR0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRGCQ6NXR0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IRGCQ6NXR0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms