Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV7

CDPF1, Cysteine-rich DPF motif domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDPF1Q6NVV7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDPF1Q6NVV7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDPF1Q6NVV7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDPF1Q6NVV7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDPF1Q6NVV7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDPF1Q6NVV7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDPF1Q6NVV7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDPF1Q6NVV7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDPF1Q6NVV7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDPF1Q6NVV7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDPF1Q6NVV7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDPF1Q6NVV7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDPF1Q6NVV7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDPF1Q6NVV7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDPF1Q6NVV7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDPF1Q6NVV7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDPF1Q6NVV7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDPF1Q6NVV7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDPF1Q6NVV7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDPF1Q6NVV7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDPF1Q6NVV7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDPF1Q6NVV7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDPF1Q6NVV7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDPF1Q6NVV7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDPF1Q6NVV7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDPF1Q6NVV7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDPF1Q6NVV7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDPF1Q6NVV7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDPF1Q6NVV7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDPF1Q6NVV7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDPF1Q6NVV7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDPF1Q6NVV7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDPF1Q6NVV7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDPF1Q6NVV7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDPF1Q6NVV7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDPF1Q6NVV7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDPF1Q6NVV7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDPF1Q6NVV7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDPF1Q6NVV7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDPF1Q6NVV7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDPF1Q6NVV7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDPF1Q6NVV7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDPF1Q6NVV7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDPF1Q6NVV7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDPF1Q6NVV7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDPF1Q6NVV7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDPF1Q6NVV7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDPF1Q6NVV7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDPF1Q6NVV7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDPF1Q6NVV7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDPF1Q6NVV7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDPF1Q6NVV7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDPF1Q6NVV7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDPF1Q6NVV7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDPF1Q6NVV7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDPF1Q6NVV7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDPF1Q6NVV7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDPF1Q6NVV7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDPF1Q6NVV7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDPF1Q6NVV7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDPF1Q6NVV7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CDPF1Q6NVV7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDPF1Q6NVV7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDPF1Q6NVV7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDPF1Q6NVV7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDPF1Q6NVV7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDPF1Q6NVV7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDPF1Q6NVV7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDPF1Q6NVV7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDPF1Q6NVV7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDPF1Q6NVV7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDPF1Q6NVV7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDPF1Q6NVV7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDPF1Q6NVV7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDPF1Q6NVV7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDPF1Q6NVV7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDPF1Q6NVV7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms