Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE5

LCN12, Epididymal-specific lipocalin-12, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN12Q6JVE5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LCN12Q6JVE5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LCN12Q6JVE5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN12Q6JVE5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LCN12Q6JVE5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LCN12Q6JVE5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LCN12Q6JVE5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LCN12Q6JVE5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LCN12Q6JVE5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN12Q6JVE5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LCN12Q6JVE5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LCN12Q6JVE5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LCN12Q6JVE5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LCN12Q6JVE5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LCN12Q6JVE5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN12Q6JVE5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN12Q6JVE5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN12Q6JVE5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LCN12Q6JVE5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN12Q6JVE5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LCN12Q6JVE5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LCN12Q6JVE5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LCN12Q6JVE5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN12Q6JVE5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN12Q6JVE5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LCN12Q6JVE5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN12Q6JVE5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LCN12Q6JVE5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LCN12Q6JVE5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LCN12Q6JVE5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN12Q6JVE5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LCN12Q6JVE5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LCN12Q6JVE5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LCN12Q6JVE5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LCN12Q6JVE5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN12Q6JVE5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LCN12Q6JVE5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN12Q6JVE5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN12Q6JVE5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LCN12Q6JVE5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN12Q6JVE5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LCN12Q6JVE5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LCN12Q6JVE5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LCN12Q6JVE5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LCN12Q6JVE5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN12Q6JVE5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN12Q6JVE5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LCN12Q6JVE5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LCN12Q6JVE5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCN12Q6JVE5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LCN12Q6JVE5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LCN12Q6JVE5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LCN12Q6JVE5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN12Q6JVE5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN12Q6JVE5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LCN12Q6JVE5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN12Q6JVE5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCN12Q6JVE5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCN12Q6JVE5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCN12Q6JVE5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCN12Q6JVE5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LCN12Q6JVE5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LCN12Q6JVE5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN12Q6JVE5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN12Q6JVE5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN12Q6JVE5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LCN12Q6JVE5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LCN12Q6JVE5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LCN12Q6JVE5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms