Protein–RNA interactions for Protein: Q56P42

PYDC2, Pyrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC2Q56P42 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYDC2Q56P42 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PYDC2Q56P42 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PYDC2Q56P42 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYDC2Q56P42 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PYDC2Q56P42 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYDC2Q56P42 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PYDC2Q56P42 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYDC2Q56P42 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PYDC2Q56P42 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PYDC2Q56P42 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYDC2Q56P42 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PYDC2Q56P42 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PYDC2Q56P42 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PYDC2Q56P42 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYDC2Q56P42 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PYDC2Q56P42 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PYDC2Q56P42 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYDC2Q56P42 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PYDC2Q56P42 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PYDC2Q56P42 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYDC2Q56P42 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PYDC2Q56P42 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PYDC2Q56P42 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PYDC2Q56P42 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PYDC2Q56P42 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYDC2Q56P42 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PYDC2Q56P42 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYDC2Q56P42 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PYDC2Q56P42 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYDC2Q56P42 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYDC2Q56P42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PYDC2Q56P42 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PYDC2Q56P42 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PYDC2Q56P42 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYDC2Q56P42 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PYDC2Q56P42 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PYDC2Q56P42 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PYDC2Q56P42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PYDC2Q56P42 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PYDC2Q56P42 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYDC2Q56P42 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PYDC2Q56P42 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYDC2Q56P42 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PYDC2Q56P42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PYDC2Q56P42 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PYDC2Q56P42 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PYDC2Q56P42 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PYDC2Q56P42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PYDC2Q56P42 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PYDC2Q56P42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PYDC2Q56P42 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PYDC2Q56P42 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PYDC2Q56P42 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PYDC2Q56P42 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PYDC2Q56P42 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PYDC2Q56P42 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PYDC2Q56P42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PYDC2Q56P42 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PYDC2Q56P42 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PYDC2Q56P42 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PYDC2Q56P42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYDC2Q56P42 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYDC2Q56P42 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PYDC2Q56P42 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PYDC2Q56P42 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PYDC2Q56P42 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYDC2Q56P42 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PYDC2Q56P42 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PYDC2Q56P42 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PYDC2Q56P42 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PYDC2Q56P42 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PYDC2Q56P42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PYDC2Q56P42 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PYDC2Q56P42 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYDC2Q56P42 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PYDC2Q56P42 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PYDC2Q56P42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PYDC2Q56P42 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms