Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNN3Q15417 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNN3Q15417 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNN3Q15417 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNN3Q15417 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNN3Q15417 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNN3Q15417 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNN3Q15417 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNN3Q15417 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CNN3Q15417 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CNN3Q15417 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CNN3Q15417 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CNN3Q15417 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CNN3Q15417 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNN3Q15417 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CNN3Q15417 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CNN3Q15417 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CNN3Q15417 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNN3Q15417 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNN3Q15417 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNN3Q15417 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNN3Q15417 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNN3Q15417 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNN3Q15417 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNN3Q15417 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNN3Q15417 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNN3Q15417 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNN3Q15417 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNN3Q15417 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNN3Q15417 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNN3Q15417 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNN3Q15417 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNN3Q15417 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNN3Q15417 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNN3Q15417 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNN3Q15417 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNN3Q15417 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNN3Q15417 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNN3Q15417 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNN3Q15417 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNN3Q15417 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNN3Q15417 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNN3Q15417 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNN3Q15417 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNN3Q15417 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNN3Q15417 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNN3Q15417 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNN3Q15417 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNN3Q15417 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNN3Q15417 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNN3Q15417 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNN3Q15417 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNN3Q15417 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNN3Q15417 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNN3Q15417 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNN3Q15417 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNN3Q15417 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNN3Q15417 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNN3Q15417 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNN3Q15417 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNN3Q15417 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNN3Q15417 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CNN3Q15417 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNN3Q15417 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNN3Q15417 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNN3Q15417 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNN3Q15417 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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