Protein–RNA interactions for Protein: Q15291

RBBP5, Retinoblastoma-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP5Q15291 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RBBP5Q15291 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBBP5Q15291 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBBP5Q15291 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBBP5Q15291 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBBP5Q15291 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBBP5Q15291 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBBP5Q15291 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBBP5Q15291 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBBP5Q15291 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBBP5Q15291 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBBP5Q15291 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBBP5Q15291 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBBP5Q15291 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBBP5Q15291 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBBP5Q15291 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RBBP5Q15291 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RBBP5Q15291 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RBBP5Q15291 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RBBP5Q15291 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RBBP5Q15291 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RBBP5Q15291 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RBBP5Q15291 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RBBP5Q15291 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RBBP5Q15291 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RBBP5Q15291 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RBBP5Q15291 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RBBP5Q15291 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RBBP5Q15291 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RBBP5Q15291 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP5Q15291 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBBP5Q15291 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP5Q15291 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP5Q15291 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBBP5Q15291 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBBP5Q15291 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBBP5Q15291 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBBP5Q15291 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RBBP5Q15291 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBBP5Q15291 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBBP5Q15291 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBBP5Q15291 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBBP5Q15291 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBBP5Q15291 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBBP5Q15291 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBBP5Q15291 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBBP5Q15291 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBBP5Q15291 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RBBP5Q15291 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBBP5Q15291 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBBP5Q15291 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBBP5Q15291 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBBP5Q15291 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RBBP5Q15291 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RBBP5Q15291 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBBP5Q15291 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP5Q15291 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP5Q15291 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP5Q15291 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBBP5Q15291 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBBP5Q15291 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP5Q15291 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBBP5Q15291 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP5Q15291 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBBP5Q15291 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RBBP5Q15291 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP5Q15291 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RBBP5Q15291 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RBBP5Q15291 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBBP5Q15291 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RBBP5Q15291 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RBBP5Q15291 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP5Q15291 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP5Q15291 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RBBP5Q15291 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP5Q15291 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RBBP5Q15291 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RBBP5Q15291 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms