Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPIDRQ14159 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SPIDRQ14159 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPIDRQ14159 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPIDRQ14159 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPIDRQ14159 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPIDRQ14159 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPIDRQ14159 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPIDRQ14159 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPIDRQ14159 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPIDRQ14159 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPIDRQ14159 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SPIDRQ14159 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPIDRQ14159 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SPIDRQ14159 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SPIDRQ14159 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SPIDRQ14159 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SPIDRQ14159 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SPIDRQ14159 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SPIDRQ14159 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SPIDRQ14159 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SPIDRQ14159 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPIDRQ14159 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SPIDRQ14159 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SPIDRQ14159 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPIDRQ14159 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SPIDRQ14159 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIDRQ14159 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SPIDRQ14159 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SPIDRQ14159 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SPIDRQ14159 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SPIDRQ14159 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SPIDRQ14159 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SPIDRQ14159 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPIDRQ14159 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SPIDRQ14159 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SPIDRQ14159 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SPIDRQ14159 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SPIDRQ14159 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SPIDRQ14159 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPIDRQ14159 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SPIDRQ14159 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SPIDRQ14159 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SPIDRQ14159 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SPIDRQ14159 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SPIDRQ14159 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIDRQ14159 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIDRQ14159 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SPIDRQ14159 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIDRQ14159 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SPIDRQ14159 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SPIDRQ14159 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SPIDRQ14159 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPIDRQ14159 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SPIDRQ14159 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPIDRQ14159 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SPIDRQ14159 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPIDRQ14159 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SPIDRQ14159 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SPIDRQ14159 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SPIDRQ14159 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPIDRQ14159 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SPIDRQ14159 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPIDRQ14159 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SPIDRQ14159 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SPIDRQ14159 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPIDRQ14159 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SPIDRQ14159 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SPIDRQ14159 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SPIDRQ14159 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SPIDRQ14159 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SPIDRQ14159 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SPIDRQ14159 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SPIDRQ14159 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPIDRQ14159 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SPIDRQ14159 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPIDRQ14159 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SPIDRQ14159 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPIDRQ14159 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPIDRQ14159 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPIDRQ14159 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SPIDRQ14159 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SPIDRQ14159 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPIDRQ14159 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPIDRQ14159 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
SPIDRQ14159 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPIDRQ14159 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIDRQ14159 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPIDRQ14159 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPIDRQ14159 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPIDRQ14159 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPIDRQ14159 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPIDRQ14159 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPIDRQ14159 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIDRQ14159 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPIDRQ14159 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPIDRQ14159 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIDRQ14159 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIDRQ14159 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SPIDRQ14159 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
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