Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SPIDRQ14159 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
SPIDRQ14159 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SPIDRQ14159 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SPIDRQ14159 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SPIDRQ14159 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SPIDRQ14159 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SPIDRQ14159 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
SPIDRQ14159 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SPIDRQ14159 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SPIDRQ14159 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SPIDRQ14159 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SPIDRQ14159 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SPIDRQ14159 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SPIDRQ14159 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SPIDRQ14159 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SPIDRQ14159 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SPIDRQ14159 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SPIDRQ14159 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SPIDRQ14159 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SPIDRQ14159 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SPIDRQ14159 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SPIDRQ14159 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SPIDRQ14159 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPIDRQ14159 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPIDRQ14159 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SPIDRQ14159 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SPIDRQ14159 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SPIDRQ14159 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SPIDRQ14159 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPIDRQ14159 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SPIDRQ14159 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SPIDRQ14159 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SPIDRQ14159 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SPIDRQ14159 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SPIDRQ14159 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPIDRQ14159 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SPIDRQ14159 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SPIDRQ14159 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SPIDRQ14159 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SPIDRQ14159 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SPIDRQ14159 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SPIDRQ14159 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SPIDRQ14159 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SPIDRQ14159 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SPIDRQ14159 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SPIDRQ14159 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SPIDRQ14159 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPIDRQ14159 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPIDRQ14159 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPIDRQ14159 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPIDRQ14159 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPIDRQ14159 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPIDRQ14159 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPIDRQ14159 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPIDRQ14159 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPIDRQ14159 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPIDRQ14159 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPIDRQ14159 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPIDRQ14159 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPIDRQ14159 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPIDRQ14159 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPIDRQ14159 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPIDRQ14159 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SPIDRQ14159 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPIDRQ14159 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPIDRQ14159 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPIDRQ14159 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPIDRQ14159 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPIDRQ14159 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPIDRQ14159 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPIDRQ14159 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPIDRQ14159 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPIDRQ14159 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPIDRQ14159 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPIDRQ14159 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPIDRQ14159 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPIDRQ14159 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPIDRQ14159 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPIDRQ14159 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPIDRQ14159 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPIDRQ14159 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPIDRQ14159 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPIDRQ14159 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPIDRQ14159 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPIDRQ14159 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPIDRQ14159 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPIDRQ14159 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPIDRQ14159 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPIDRQ14159 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPIDRQ14159 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPIDRQ14159 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SPIDRQ14159 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SPIDRQ14159 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SPIDRQ14159 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPIDRQ14159 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPIDRQ14159 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPIDRQ14159 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPIDRQ14159 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPIDRQ14159 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
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