Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TRIM29Q14134 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TRIM29Q14134 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TRIM29Q14134 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM29Q14134 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TRIM29Q14134 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
TRIM29Q14134 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM29Q14134 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TRIM29Q14134 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TRIM29Q14134 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TRIM29Q14134 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TRIM29Q14134 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TRIM29Q14134 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM29Q14134 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
TRIM29Q14134 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM29Q14134 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRIM29Q14134 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM29Q14134 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TRIM29Q14134 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM29Q14134 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TRIM29Q14134 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TRIM29Q14134 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
TRIM29Q14134 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM29Q14134 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRIM29Q14134 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
TRIM29Q14134 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TRIM29Q14134 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRIM29Q14134 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM29Q14134 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM29Q14134 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
TRIM29Q14134 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRIM29Q14134 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRIM29Q14134 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
TRIM29Q14134 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRIM29Q14134 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRIM29Q14134 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRIM29Q14134 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRIM29Q14134 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRIM29Q14134 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRIM29Q14134 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM29Q14134 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM29Q14134 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRIM29Q14134 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM29Q14134 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRIM29Q14134 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRIM29Q14134 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRIM29Q14134 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRIM29Q14134 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM29Q14134 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM29Q14134 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRIM29Q14134 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
TRIM29Q14134 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRIM29Q14134 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRIM29Q14134 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRIM29Q14134 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRIM29Q14134 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM29Q14134 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM29Q14134 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM29Q14134 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM29Q14134 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM29Q14134 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM29Q14134 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM29Q14134 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TRIM29Q14134 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM29Q14134 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRIM29Q14134 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRIM29Q14134 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRIM29Q14134 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM29Q14134 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM29Q14134 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
TRIM29Q14134 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRIM29Q14134 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TRIM29Q14134 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM29Q14134 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM29Q14134 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TRIM29Q14134 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM29Q14134 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRIM29Q14134 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms