Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX39BQ13838 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX39BQ13838 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX39BQ13838 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX39BQ13838 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX39BQ13838 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX39BQ13838 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX39BQ13838 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX39BQ13838 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX39BQ13838 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX39BQ13838 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX39BQ13838 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX39BQ13838 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX39BQ13838 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX39BQ13838 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX39BQ13838 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX39BQ13838 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX39BQ13838 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX39BQ13838 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX39BQ13838 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX39BQ13838 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX39BQ13838 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX39BQ13838 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX39BQ13838 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX39BQ13838 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX39BQ13838 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX39BQ13838 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39BQ13838 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39BQ13838 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX39BQ13838 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX39BQ13838 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX39BQ13838 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39BQ13838 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39BQ13838 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX39BQ13838 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX39BQ13838 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX39BQ13838 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX39BQ13838 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX39BQ13838 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX39BQ13838 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX39BQ13838 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX39BQ13838 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX39BQ13838 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX39BQ13838 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX39BQ13838 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX39BQ13838 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX39BQ13838 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX39BQ13838 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX39BQ13838 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX39BQ13838 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX39BQ13838 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX39BQ13838 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX39BQ13838 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX39BQ13838 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX39BQ13838 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX39BQ13838 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX39BQ13838 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX39BQ13838 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX39BQ13838 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX39BQ13838 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX39BQ13838 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX39BQ13838 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX39BQ13838 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX39BQ13838 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX39BQ13838 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX39BQ13838 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX39BQ13838 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX39BQ13838 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX39BQ13838 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX39BQ13838 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX39BQ13838 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX39BQ13838 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX39BQ13838 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX39BQ13838 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX39BQ13838 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX39BQ13838 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX39BQ13838 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX39BQ13838 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX39BQ13838 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX39BQ13838 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX39BQ13838 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX39BQ13838 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX39BQ13838 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX39BQ13838 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX39BQ13838 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX39BQ13838 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
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