Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAF3Q13114 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAF3Q13114 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF3Q13114 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAF3Q13114 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAF3Q13114 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAF3Q13114 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAF3Q13114 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAF3Q13114 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAF3Q13114 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF3Q13114 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRAF3Q13114 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRAF3Q13114 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF3Q13114 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRAF3Q13114 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRAF3Q13114 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRAF3Q13114 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRAF3Q13114 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRAF3Q13114 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRAF3Q13114 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRAF3Q13114 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRAF3Q13114 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF3Q13114 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRAF3Q13114 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF3Q13114 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF3Q13114 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF3Q13114 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3Q13114 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3Q13114 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3Q13114 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF3Q13114 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF3Q13114 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF3Q13114 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF3Q13114 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3Q13114 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3Q13114 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF3Q13114 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF3Q13114 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF3Q13114 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAF3Q13114 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3Q13114 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3Q13114 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3Q13114 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3Q13114 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3Q13114 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF3Q13114 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF3Q13114 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF3Q13114 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF3Q13114 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF3Q13114 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF3Q13114 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF3Q13114 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF3Q13114 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3Q13114 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3Q13114 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF3Q13114 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF3Q13114 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF3Q13114 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF3Q13114 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAF3Q13114 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAF3Q13114 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF3Q13114 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAF3Q13114 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF3Q13114 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF3Q13114 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF3Q13114 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAF3Q13114 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRAF3Q13114 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRAF3Q13114 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF3Q13114 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAF3Q13114 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAF3Q13114 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF3Q13114 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF3Q13114 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF3Q13114 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF3Q13114 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF3Q13114 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF3Q13114 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3Q13114 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF3Q13114 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF3Q13114 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF3Q13114 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF3Q13114 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF3Q13114 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF3Q13114 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF3Q13114 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF3Q13114 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF3Q13114 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF3Q13114 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF3Q13114 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
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