Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
STX4Q12846 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
STX4Q12846 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX4Q12846 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
STX4Q12846 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
STX4Q12846 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
STX4Q12846 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
STX4Q12846 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
STX4Q12846 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
STX4Q12846 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
STX4Q12846 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
STX4Q12846 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
STX4Q12846 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
STX4Q12846 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
STX4Q12846 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
STX4Q12846 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX4Q12846 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX4Q12846 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX4Q12846 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX4Q12846 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX4Q12846 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STX4Q12846 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
STX4Q12846 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX4Q12846 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
STX4Q12846 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX4Q12846 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX4Q12846 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
STX4Q12846 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
STX4Q12846 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX4Q12846 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX4Q12846 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX4Q12846 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX4Q12846 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX4Q12846 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX4Q12846 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
STX4Q12846 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX4Q12846 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX4Q12846 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX4Q12846 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX4Q12846 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX4Q12846 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX4Q12846 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STX4Q12846 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX4Q12846 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX4Q12846 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
STX4Q12846 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
STX4Q12846 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX4Q12846 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX4Q12846 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
STX4Q12846 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX4Q12846 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX4Q12846 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
STX4Q12846 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX4Q12846 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX4Q12846 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX4Q12846 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX4Q12846 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STX4Q12846 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STX4Q12846 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX4Q12846 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
STX4Q12846 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX4Q12846 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX4Q12846 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX4Q12846 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX4Q12846 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX4Q12846 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX4Q12846 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX4Q12846 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX4Q12846 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX4Q12846 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX4Q12846 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX4Q12846 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX4Q12846 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX4Q12846 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX4Q12846 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX4Q12846 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX4Q12846 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX4Q12846 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX4Q12846 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX4Q12846 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX4Q12846 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX4Q12846 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX4Q12846 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX4Q12846 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX4Q12846 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX4Q12846 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STX4Q12846 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STX4Q12846 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STX4Q12846 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STX4Q12846 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STX4Q12846 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STX4Q12846 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STX4Q12846 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STX4Q12846 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STX4Q12846 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STX4Q12846 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX4Q12846 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX4Q12846 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STX4Q12846 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
STX4Q12846 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms