Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCBP1Q09161 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCBP1Q09161 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCBP1Q09161 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
NCBP1Q09161 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCBP1Q09161 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NCBP1Q09161 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCBP1Q09161 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCBP1Q09161 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
NCBP1Q09161 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCBP1Q09161 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NCBP1Q09161 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCBP1Q09161 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCBP1Q09161 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NCBP1Q09161 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCBP1Q09161 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCBP1Q09161 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCBP1Q09161 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCBP1Q09161 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCBP1Q09161 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NCBP1Q09161 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCBP1Q09161 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCBP1Q09161 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NCBP1Q09161 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NCBP1Q09161 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCBP1Q09161 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCBP1Q09161 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NCBP1Q09161 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NCBP1Q09161 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCBP1Q09161 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NCBP1Q09161 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
NCBP1Q09161 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NCBP1Q09161 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCBP1Q09161 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCBP1Q09161 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCBP1Q09161 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCBP1Q09161 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCBP1Q09161 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCBP1Q09161 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCBP1Q09161 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCBP1Q09161 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCBP1Q09161 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NCBP1Q09161 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NCBP1Q09161 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NCBP1Q09161 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
NCBP1Q09161 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCBP1Q09161 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NCBP1Q09161 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCBP1Q09161 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCBP1Q09161 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NCBP1Q09161 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NCBP1Q09161 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCBP1Q09161 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
NCBP1Q09161 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NCBP1Q09161 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
NCBP1Q09161 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCBP1Q09161 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NCBP1Q09161 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NCBP1Q09161 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCBP1Q09161 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NCBP1Q09161 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NCBP1Q09161 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NCBP1Q09161 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NCBP1Q09161 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NCBP1Q09161 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
NCBP1Q09161 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NCBP1Q09161 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NCBP1Q09161 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NCBP1Q09161 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NCBP1Q09161 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCBP1Q09161 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NCBP1Q09161 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCBP1Q09161 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCBP1Q09161 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NCBP1Q09161 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NCBP1Q09161 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NCBP1Q09161 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NCBP1Q09161 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NCBP1Q09161 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NCBP1Q09161 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCBP1Q09161 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NCBP1Q09161 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCBP1Q09161 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCBP1Q09161 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NCBP1Q09161 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NCBP1Q09161 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCBP1Q09161 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NCBP1Q09161 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NCBP1Q09161 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NCBP1Q09161 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms