Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CD164Q04900 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CD164Q04900 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD164Q04900 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CD164Q04900 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD164Q04900 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD164Q04900 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD164Q04900 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD164Q04900 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD164Q04900 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD164Q04900 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD164Q04900 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD164Q04900 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD164Q04900 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD164Q04900 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD164Q04900 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD164Q04900 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD164Q04900 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD164Q04900 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD164Q04900 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD164Q04900 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CD164Q04900 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD164Q04900 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD164Q04900 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD164Q04900 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD164Q04900 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD164Q04900 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD164Q04900 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD164Q04900 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD164Q04900 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CD164Q04900 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CD164Q04900 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD164Q04900 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD164Q04900 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD164Q04900 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD164Q04900 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD164Q04900 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD164Q04900 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD164Q04900 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD164Q04900 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD164Q04900 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD164Q04900 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD164Q04900 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CD164Q04900 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD164Q04900 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD164Q04900 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD164Q04900 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CD164Q04900 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD164Q04900 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD164Q04900 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD164Q04900 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD164Q04900 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CD164Q04900 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CD164Q04900 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD164Q04900 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD164Q04900 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD164Q04900 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD164Q04900 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD164Q04900 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD164Q04900 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD164Q04900 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD164Q04900 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CD164Q04900 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CD164Q04900 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD164Q04900 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CD164Q04900 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CD164Q04900 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CD164Q04900 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD164Q04900 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CD164Q04900 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD164Q04900 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD164Q04900 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD164Q04900 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CD164Q04900 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD164Q04900 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD164Q04900 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CD164Q04900 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CD164Q04900 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD164Q04900 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD164Q04900 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD164Q04900 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD164Q04900 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD164Q04900 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD164Q04900 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD164Q04900 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD164Q04900 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD164Q04900 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD164Q04900 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD164Q04900 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CD164Q04900 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD164Q04900 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CD164Q04900 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD164Q04900 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CD164Q04900 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CD164Q04900 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD164Q04900 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CD164Q04900 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD164Q04900 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD164Q04900 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CD164Q04900 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms