Protein–RNA interactions for Protein: Q03393

PTS, 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTSQ03393 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTSQ03393 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PTSQ03393 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTSQ03393 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTSQ03393 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTSQ03393 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTSQ03393 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTSQ03393 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTSQ03393 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTSQ03393 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTSQ03393 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTSQ03393 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTSQ03393 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTSQ03393 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTSQ03393 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTSQ03393 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTSQ03393 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTSQ03393 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTSQ03393 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTSQ03393 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTSQ03393 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTSQ03393 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTSQ03393 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTSQ03393 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTSQ03393 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTSQ03393 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTSQ03393 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTSQ03393 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTSQ03393 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTSQ03393 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTSQ03393 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTSQ03393 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTSQ03393 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTSQ03393 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PTSQ03393 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTSQ03393 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTSQ03393 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTSQ03393 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PTSQ03393 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTSQ03393 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTSQ03393 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTSQ03393 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTSQ03393 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTSQ03393 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTSQ03393 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTSQ03393 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTSQ03393 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTSQ03393 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTSQ03393 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTSQ03393 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTSQ03393 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTSQ03393 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTSQ03393 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTSQ03393 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTSQ03393 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTSQ03393 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTSQ03393 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTSQ03393 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTSQ03393 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTSQ03393 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTSQ03393 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTSQ03393 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTSQ03393 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTSQ03393 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTSQ03393 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTSQ03393 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTSQ03393 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTSQ03393 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTSQ03393 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PTSQ03393 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PTSQ03393 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PTSQ03393 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTSQ03393 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTSQ03393 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PTSQ03393 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PTSQ03393 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTSQ03393 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PTSQ03393 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PTSQ03393 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PTSQ03393 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTSQ03393 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PTSQ03393 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTSQ03393 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PTSQ03393 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTSQ03393 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTSQ03393 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTSQ03393 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTSQ03393 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTSQ03393 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTSQ03393 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTSQ03393 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTSQ03393 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTSQ03393 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTSQ03393 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTSQ03393 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTSQ03393 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTSQ03393 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTSQ03393 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTSQ03393 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTSQ03393 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms