Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
LMNB2Q03252 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
LMNB2Q03252 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMNB2Q03252 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMNB2Q03252 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMNB2Q03252 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMNB2Q03252 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMNB2Q03252 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
LMNB2Q03252 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
LMNB2Q03252 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMNB2Q03252 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
LMNB2Q03252 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMNB2Q03252 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMNB2Q03252 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
LMNB2Q03252 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
LMNB2Q03252 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
LMNB2Q03252 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
LMNB2Q03252 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
LMNB2Q03252 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
LMNB2Q03252 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
LMNB2Q03252 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LMNB2Q03252 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMNB2Q03252 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMNB2Q03252 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMNB2Q03252 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMNB2Q03252 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMNB2Q03252 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMNB2Q03252 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNB2Q03252 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNB2Q03252 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNB2Q03252 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNB2Q03252 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMNB2Q03252 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMNB2Q03252 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
LMNB2Q03252 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMNB2Q03252 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMNB2Q03252 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMNB2Q03252 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMNB2Q03252 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMNB2Q03252 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMNB2Q03252 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMNB2Q03252 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMNB2Q03252 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LMNB2Q03252 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMNB2Q03252 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMNB2Q03252 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMNB2Q03252 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMNB2Q03252 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMNB2Q03252 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMNB2Q03252 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LMNB2Q03252 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMNB2Q03252 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMNB2Q03252 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMNB2Q03252 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMNB2Q03252 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMNB2Q03252 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMNB2Q03252 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMNB2Q03252 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMNB2Q03252 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB2Q03252 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB2Q03252 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB2Q03252 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMNB2Q03252 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMNB2Q03252 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMNB2Q03252 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMNB2Q03252 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMNB2Q03252 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LMNB2Q03252 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMNB2Q03252 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
LMNB2Q03252 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMNB2Q03252 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNB2Q03252 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMNB2Q03252 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMNB2Q03252 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMNB2Q03252 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMNB2Q03252 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMNB2Q03252 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMNB2Q03252 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMNB2Q03252 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LMNB2Q03252 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms