Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLOD1Q02809 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLOD1Q02809 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLOD1Q02809 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLOD1Q02809 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLOD1Q02809 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLOD1Q02809 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLOD1Q02809 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLOD1Q02809 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLOD1Q02809 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PLOD1Q02809 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PLOD1Q02809 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLOD1Q02809 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLOD1Q02809 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLOD1Q02809 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLOD1Q02809 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLOD1Q02809 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLOD1Q02809 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLOD1Q02809 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLOD1Q02809 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLOD1Q02809 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLOD1Q02809 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLOD1Q02809 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLOD1Q02809 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLOD1Q02809 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLOD1Q02809 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLOD1Q02809 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLOD1Q02809 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PLOD1Q02809 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLOD1Q02809 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLOD1Q02809 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLOD1Q02809 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLOD1Q02809 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PLOD1Q02809 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLOD1Q02809 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLOD1Q02809 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLOD1Q02809 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLOD1Q02809 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLOD1Q02809 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLOD1Q02809 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLOD1Q02809 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PLOD1Q02809 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLOD1Q02809 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLOD1Q02809 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLOD1Q02809 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLOD1Q02809 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLOD1Q02809 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLOD1Q02809 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLOD1Q02809 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLOD1Q02809 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLOD1Q02809 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLOD1Q02809 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLOD1Q02809 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLOD1Q02809 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PLOD1Q02809 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLOD1Q02809 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLOD1Q02809 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLOD1Q02809 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLOD1Q02809 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PLOD1Q02809 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLOD1Q02809 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLOD1Q02809 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLOD1Q02809 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLOD1Q02809 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLOD1Q02809 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLOD1Q02809 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLOD1Q02809 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLOD1Q02809 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLOD1Q02809 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLOD1Q02809 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLOD1Q02809 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLOD1Q02809 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLOD1Q02809 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLOD1Q02809 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLOD1Q02809 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLOD1Q02809 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLOD1Q02809 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PLOD1Q02809 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLOD1Q02809 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLOD1Q02809 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLOD1Q02809 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLOD1Q02809 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLOD1Q02809 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PLOD1Q02809 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLOD1Q02809 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PLOD1Q02809 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PLOD1Q02809 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLOD1Q02809 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLOD1Q02809 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PLOD1Q02809 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLOD1Q02809 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLOD1Q02809 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLOD1Q02809 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLOD1Q02809 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLOD1Q02809 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLOD1Q02809 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLOD1Q02809 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLOD1Q02809 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLOD1Q02809 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLOD1Q02809 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms