Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIST1H1AQ02539 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HIST1H1AQ02539 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HIST1H1AQ02539 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST1H1AQ02539 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST1H1AQ02539 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HIST1H1AQ02539 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIST1H1AQ02539 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIST1H1AQ02539 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIST1H1AQ02539 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HIST1H1AQ02539 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIST1H1AQ02539 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIST1H1AQ02539 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIST1H1AQ02539 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIST1H1AQ02539 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIST1H1AQ02539 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST1H1AQ02539 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST1H1AQ02539 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIST1H1AQ02539 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIST1H1AQ02539 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST1H1AQ02539 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST1H1AQ02539 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST1H1AQ02539 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIST1H1AQ02539 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIST1H1AQ02539 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST1H1AQ02539 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST1H1AQ02539 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIST1H1AQ02539 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST1H1AQ02539 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIST1H1AQ02539 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST1H1AQ02539 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIST1H1AQ02539 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST1H1AQ02539 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIST1H1AQ02539 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST1H1AQ02539 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIST1H1AQ02539 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIST1H1AQ02539 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIST1H1AQ02539 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIST1H1AQ02539 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIST1H1AQ02539 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIST1H1AQ02539 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H1AQ02539 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIST1H1AQ02539 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIST1H1AQ02539 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HIST1H1AQ02539 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HIST1H1AQ02539 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST1H1AQ02539 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST1H1AQ02539 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HIST1H1AQ02539 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HIST1H1AQ02539 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HIST1H1AQ02539 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HIST1H1AQ02539 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HIST1H1AQ02539 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIST1H1AQ02539 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms