Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RUNX1Q01196 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RUNX1Q01196 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RUNX1Q01196 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX1Q01196 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RUNX1Q01196 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX1Q01196 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX1Q01196 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RUNX1Q01196 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RUNX1Q01196 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RUNX1Q01196 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RUNX1Q01196 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX1Q01196 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RUNX1Q01196 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RUNX1Q01196 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RUNX1Q01196 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RUNX1Q01196 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX1Q01196 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RUNX1Q01196 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX1Q01196 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX1Q01196 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RUNX1Q01196 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RUNX1Q01196 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX1Q01196 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX1Q01196 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RUNX1Q01196 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RUNX1Q01196 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1Q01196 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1Q01196 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1Q01196 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RUNX1Q01196 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RUNX1Q01196 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RUNX1Q01196 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX1Q01196 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RUNX1Q01196 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX1Q01196 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX1Q01196 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX1Q01196 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX1Q01196 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX1Q01196 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX1Q01196 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX1Q01196 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX1Q01196 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX1Q01196 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX1Q01196 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX1Q01196 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX1Q01196 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX1Q01196 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX1Q01196 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX1Q01196 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX1Q01196 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUNX1Q01196 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX1Q01196 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUNX1Q01196 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RUNX1Q01196 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX1Q01196 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX1Q01196 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX1Q01196 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RUNX1Q01196 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RUNX1Q01196 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RUNX1Q01196 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNX1Q01196 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNX1Q01196 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RUNX1Q01196 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX1Q01196 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNX1Q01196 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX1Q01196 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNX1Q01196 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNX1Q01196 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNX1Q01196 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX1Q01196 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNX1Q01196 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1Q01196 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RUNX1Q01196 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX1Q01196 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RUNX1Q01196 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUNX1Q01196 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNX1Q01196 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RUNX1Q01196 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms