Protein–RNA interactions for Protein: P98179

RBM3, RNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3P98179 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM3P98179 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM3P98179 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBM3P98179 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM3P98179 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBM3P98179 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM3P98179 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM3P98179 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBM3P98179 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM3P98179 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RBM3P98179 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM3P98179 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RBM3P98179 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM3P98179 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RBM3P98179 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM3P98179 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RBM3P98179 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM3P98179 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM3P98179 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM3P98179 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RBM3P98179 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM3P98179 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM3P98179 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RBM3P98179 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RBM3P98179 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RBM3P98179 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM3P98179 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBM3P98179 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM3P98179 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBM3P98179 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM3P98179 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM3P98179 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM3P98179 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM3P98179 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM3P98179 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBM3P98179 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBM3P98179 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM3P98179 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM3P98179 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM3P98179 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM3P98179 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM3P98179 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM3P98179 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM3P98179 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM3P98179 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM3P98179 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM3P98179 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RBM3P98179 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RBM3P98179 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBM3P98179 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBM3P98179 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RBM3P98179 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM3P98179 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RBM3P98179 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM3P98179 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RBM3P98179 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RBM3P98179 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM3P98179 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM3P98179 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RBM3P98179 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM3P98179 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM3P98179 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RBM3P98179 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM3P98179 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RBM3P98179 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM3P98179 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RBM3P98179 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RBM3P98179 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBM3P98179 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM3P98179 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBM3P98179 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBM3P98179 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM3P98179 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM3P98179 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RBM3P98179 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBM3P98179 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM3P98179 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM3P98179 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM3P98179 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM3P98179 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM3P98179 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM3P98179 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM3P98179 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM3P98179 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM3P98179 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM3P98179 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM3P98179 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM3P98179 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM3P98179 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RBM3P98179 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM3P98179 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM3P98179 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM3P98179 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM3P98179 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM3P98179 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RBM3P98179 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RBM3P98179 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RBM3P98179 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RBM3P98179 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RBM3P98179 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms