Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RPS28P62857 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RPS28P62857 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RPS28P62857 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RPS28P62857 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS28P62857 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS28P62857 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS28P62857 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPS28P62857 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS28P62857 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPS28P62857 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPS28P62857 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RPS28P62857 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RPS28P62857 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPS28P62857 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RPS28P62857 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS28P62857 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS28P62857 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RPS28P62857 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RPS28P62857 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS28P62857 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS28P62857 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS28P62857 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS28P62857 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS28P62857 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPS28P62857 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPS28P62857 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS28P62857 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPS28P62857 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPS28P62857 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPS28P62857 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS28P62857 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RPS28P62857 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS28P62857 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS28P62857 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS28P62857 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS28P62857 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS28P62857 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS28P62857 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS28P62857 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS28P62857 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPS28P62857 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS28P62857 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS28P62857 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS28P62857 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS28P62857 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS28P62857 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS28P62857 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS28P62857 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS28P62857 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS28P62857 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS28P62857 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RPS28P62857 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPS28P62857 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS28P62857 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS28P62857 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS28P62857 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPS28P62857 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS28P62857 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS28P62857 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS28P62857 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPS28P62857 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RPS28P62857 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS28P62857 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS28P62857 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RPS28P62857 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS28P62857 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RPS28P62857 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPS28P62857 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RPS28P62857 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPS28P62857 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RPS28P62857 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS28P62857 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS28P62857 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RPS28P62857 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS28P62857 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPS28P62857 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPS28P62857 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPS28P62857 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPS28P62857 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS28P62857 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS28P62857 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPS28P62857 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPS28P62857 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS28P62857 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS28P62857 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RPS28P62857 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS28P62857 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RPS28P62857 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS28P62857 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS28P62857 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPS28P62857 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPS28P62857 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPS28P62857 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPS28P62857 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPS28P62857 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS28P62857 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPS28P62857 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS28P62857 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPS28P62857 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms