Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARPC4P59998 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARPC4P59998 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARPC4P59998 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARPC4P59998 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARPC4P59998 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARPC4P59998 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARPC4P59998 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARPC4P59998 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARPC4P59998 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARPC4P59998 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARPC4P59998 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARPC4P59998 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARPC4P59998 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARPC4P59998 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARPC4P59998 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARPC4P59998 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARPC4P59998 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARPC4P59998 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARPC4P59998 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARPC4P59998 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARPC4P59998 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARPC4P59998 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARPC4P59998 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARPC4P59998 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARPC4P59998 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARPC4P59998 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARPC4P59998 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARPC4P59998 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARPC4P59998 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ARPC4P59998 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARPC4P59998 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARPC4P59998 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARPC4P59998 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARPC4P59998 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARPC4P59998 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARPC4P59998 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARPC4P59998 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARPC4P59998 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARPC4P59998 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARPC4P59998 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARPC4P59998 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARPC4P59998 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARPC4P59998 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARPC4P59998 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARPC4P59998 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ARPC4P59998 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARPC4P59998 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARPC4P59998 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARPC4P59998 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARPC4P59998 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARPC4P59998 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARPC4P59998 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARPC4P59998 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARPC4P59998 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARPC4P59998 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARPC4P59998 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARPC4P59998 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARPC4P59998 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARPC4P59998 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARPC4P59998 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARPC4P59998 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARPC4P59998 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARPC4P59998 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARPC4P59998 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARPC4P59998 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARPC4P59998 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARPC4P59998 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARPC4P59998 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARPC4P59998 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARPC4P59998 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARPC4P59998 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARPC4P59998 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARPC4P59998 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARPC4P59998 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARPC4P59998 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARPC4P59998 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARPC4P59998 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARPC4P59998 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARPC4P59998 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARPC4P59998 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARPC4P59998 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARPC4P59998 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARPC4P59998 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARPC4P59998 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARPC4P59998 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARPC4P59998 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARPC4P59998 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARPC4P59998 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms