Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FOSBP53539 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
FOSBP53539 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
FOSBP53539 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
FOSBP53539 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOSBP53539 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
FOSBP53539 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOSBP53539 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOSBP53539 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
FOSBP53539 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOSBP53539 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOSBP53539 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOSBP53539 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOSBP53539 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOSBP53539 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
FOSBP53539 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
FOSBP53539 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOSBP53539 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOSBP53539 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
FOSBP53539 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
FOSBP53539 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FOSBP53539 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
FOSBP53539 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
FOSBP53539 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
FOSBP53539 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
FOSBP53539 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOSBP53539 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
FOSBP53539 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
FOSBP53539 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOSBP53539 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
FOSBP53539 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
FOSBP53539 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOSBP53539 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
FOSBP53539 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
FOSBP53539 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
FOSBP53539 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
FOSBP53539 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
FOSBP53539 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
FOSBP53539 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
FOSBP53539 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FOSBP53539 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
FOSBP53539 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
FOSBP53539 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
FOSBP53539 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FOSBP53539 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
FOSBP53539 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FOSBP53539 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
FOSBP53539 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
FOSBP53539 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FOSBP53539 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FOSBP53539 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
FOSBP53539 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FOSBP53539 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
FOSBP53539 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
FOSBP53539 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
FOSBP53539 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
FOSBP53539 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
FOSBP53539 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOSBP53539 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOSBP53539 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
FOSBP53539 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
FOSBP53539 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
FOSBP53539 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FOSBP53539 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FOSBP53539 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FOSBP53539 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FOSBP53539 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FOSBP53539 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FOSBP53539 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FOSBP53539 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FOSBP53539 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FOSBP53539 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOSBP53539 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FOSBP53539 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FOSBP53539 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FOSBP53539 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
FOSBP53539 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FOSBP53539 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FOSBP53539 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOSBP53539 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FOSBP53539 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
FOSBP53539 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOSBP53539 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FOSBP53539 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FOSBP53539 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FOSBP53539 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FOSBP53539 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FOSBP53539 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FOSBP53539 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FOSBP53539 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FOSBP53539 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FOSBP53539 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FOSBP53539 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FOSBP53539 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FOSBP53539 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FOSBP53539 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FOSBP53539 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FOSBP53539 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
FOSBP53539 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FOSBP53539 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms