Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RORCP51449 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RORCP51449 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RORCP51449 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RORCP51449 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RORCP51449 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RORCP51449 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RORCP51449 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RORCP51449 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RORCP51449 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RORCP51449 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RORCP51449 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RORCP51449 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RORCP51449 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RORCP51449 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RORCP51449 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RORCP51449 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RORCP51449 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RORCP51449 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RORCP51449 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RORCP51449 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RORCP51449 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RORCP51449 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RORCP51449 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RORCP51449 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RORCP51449 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RORCP51449 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RORCP51449 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RORCP51449 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RORCP51449 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RORCP51449 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RORCP51449 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RORCP51449 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RORCP51449 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RORCP51449 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RORCP51449 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RORCP51449 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RORCP51449 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RORCP51449 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RORCP51449 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RORCP51449 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RORCP51449 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RORCP51449 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RORCP51449 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RORCP51449 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RORCP51449 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RORCP51449 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RORCP51449 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RORCP51449 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RORCP51449 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RORCP51449 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RORCP51449 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RORCP51449 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RORCP51449 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RORCP51449 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RORCP51449 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RORCP51449 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RORCP51449 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RORCP51449 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RORCP51449 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RORCP51449 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RORCP51449 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RORCP51449 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RORCP51449 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RORCP51449 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RORCP51449 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RORCP51449 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RORCP51449 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RORCP51449 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RORCP51449 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RORCP51449 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RORCP51449 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RORCP51449 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RORCP51449 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RORCP51449 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RORCP51449 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RORCP51449 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RORCP51449 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RORCP51449 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RORCP51449 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RORCP51449 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RORCP51449 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RORCP51449 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RORCP51449 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RORCP51449 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RORCP51449 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RORCP51449 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RORCP51449 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RORCP51449 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RORCP51449 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RORCP51449 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RORCP51449 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RORCP51449 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RORCP51449 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RORCP51449 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RORCP51449 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RORCP51449 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RORCP51449 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RORCP51449 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RORCP51449 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms