Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NPTX2P47972 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NPTX2P47972 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NPTX2P47972 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NPTX2P47972 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
NPTX2P47972 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NPTX2P47972 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NPTX2P47972 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NPTX2P47972 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NPTX2P47972 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NPTX2P47972 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NPTX2P47972 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NPTX2P47972 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NPTX2P47972 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NPTX2P47972 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NPTX2P47972 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NPTX2P47972 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NPTX2P47972 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NPTX2P47972 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NPTX2P47972 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NPTX2P47972 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NPTX2P47972 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NPTX2P47972 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NPTX2P47972 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NPTX2P47972 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NPTX2P47972 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
NPTX2P47972 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NPTX2P47972 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
NPTX2P47972 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPTX2P47972 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPTX2P47972 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NPTX2P47972 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NPTX2P47972 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NPTX2P47972 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPTX2P47972 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPTX2P47972 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NPTX2P47972 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPTX2P47972 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NPTX2P47972 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
NPTX2P47972 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NPTX2P47972 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NPTX2P47972 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NPTX2P47972 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NPTX2P47972 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NPTX2P47972 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NPTX2P47972 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NPTX2P47972 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NPTX2P47972 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NPTX2P47972 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NPTX2P47972 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NPTX2P47972 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NPTX2P47972 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NPTX2P47972 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
NPTX2P47972 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NPTX2P47972 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NPTX2P47972 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NPTX2P47972 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NPTX2P47972 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NPTX2P47972 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NPTX2P47972 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NPTX2P47972 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NPTX2P47972 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NPTX2P47972 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NPTX2P47972 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NPTX2P47972 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NPTX2P47972 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NPTX2P47972 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NPTX2P47972 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NPTX2P47972 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NPTX2P47972 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NPTX2P47972 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NPTX2P47972 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPTX2P47972 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NPTX2P47972 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NPTX2P47972 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPTX2P47972 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPTX2P47972 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NPTX2P47972 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NPTX2P47972 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NPTX2P47972 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NPTX2P47972 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NPTX2P47972 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPTX2P47972 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPTX2P47972 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NPTX2P47972 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPTX2P47972 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPTX2P47972 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NPTX2P47972 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPTX2P47972 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPTX2P47972 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NPTX2P47972 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPTX2P47972 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPTX2P47972 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NPTX2P47972 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NPTX2P47972 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NPTX2P47972 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NPTX2P47972 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NPTX2P47972 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NPTX2P47972 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NPTX2P47972 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms