Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
ITGAEP38570 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
ITGAEP38570 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
ITGAEP38570 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
ITGAEP38570 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ITGAEP38570 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
ITGAEP38570 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
ITGAEP38570 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
ITGAEP38570 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
ITGAEP38570 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
ITGAEP38570 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
ITGAEP38570 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
ITGAEP38570 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
ITGAEP38570 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
ITGAEP38570 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
ITGAEP38570 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
ITGAEP38570 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
ITGAEP38570 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.75■■■■■ 4.59
ITGAEP38570 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
ITGAEP38570 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
ITGAEP38570 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
ITGAEP38570 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
ITGAEP38570 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
ITGAEP38570 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
ITGAEP38570 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
ITGAEP38570 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
ITGAEP38570 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
ITGAEP38570 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
ITGAEP38570 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
ITGAEP38570 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
ITGAEP38570 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
ITGAEP38570 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
ITGAEP38570 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
ITGAEP38570 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
ITGAEP38570 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
ITGAEP38570 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
ITGAEP38570 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ITGAEP38570 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ITGAEP38570 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ITGAEP38570 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
ITGAEP38570 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ITGAEP38570 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ITGAEP38570 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ITGAEP38570 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ITGAEP38570 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
ITGAEP38570 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
ITGAEP38570 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.28■■■■■ 4.52
ITGAEP38570 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ITGAEP38570 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
ITGAEP38570 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ITGAEP38570 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
ITGAEP38570 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ITGAEP38570 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
ITGAEP38570 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
ITGAEP38570 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ITGAEP38570 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ITGAEP38570 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ITGAEP38570 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ITGAEP38570 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ITGAEP38570 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ITGAEP38570 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.47
ITGAEP38570 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
ITGAEP38570 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
ITGAEP38570 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ITGAEP38570 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ITGAEP38570 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
ITGAEP38570 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
ITGAEP38570 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.45
ITGAEP38570 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
ITGAEP38570 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
ITGAEP38570 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
ITGAEP38570 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ITGAEP38570 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
ITGAEP38570 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
ITGAEP38570 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
ITGAEP38570 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ITGAEP38570 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ITGAEP38570 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
ITGAEP38570 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ITGAEP38570 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
ITGAEP38570 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
ITGAEP38570 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ITGAEP38570 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
ITGAEP38570 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
ITGAEP38570 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ITGAEP38570 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
ITGAEP38570 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
ITGAEP38570 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
ITGAEP38570 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.5■■■■■ 4.39
ITGAEP38570 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ITGAEP38570 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ITGAEP38570 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
ITGAEP38570 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
ITGAEP38570 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
ITGAEP38570 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
ITGAEP38570 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
ITGAEP38570 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ITGAEP38570 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
ITGAEP38570 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
ITGAEP38570 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms